RNA–Protein interactions for RNA: YPL283C

YRF1-7, Transcript of Helicase encoded by the Y' element of subtelomeric regions, yeastyeast

Gene YRF1-7, Length 5,580 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-7YPL283C PNP1Q05788 311 aa8.24□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C FAP7Q12055 197 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C YLL056CQ12177 298 aa8.24□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C RPN5Q12250 445 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C EMP46Q12396 444 aa8.24□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C SPO11P23179 398 aa8.23□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C DRE2P36152 348 aa8.23□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C SCS2P40075 244 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C BNI4P53858 892 aa8.23□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C YLR053CQ12026 108 aa8.23□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C SFL1P20134 766 aa8.23□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C PLC1P32383 869 aa8.23□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C HST2P53686 357 aa8.23□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C PDC5P16467 563 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C UTR4P32626 227 aa8.23□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C KEL1P38853 1164 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C CLA4P48562 842 aa8.23□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C TRS130Q03660 1102 aa8.23□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C CIR2Q08822 631 aa8.23□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C YSC83P32792 385 aa8.23□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C COS6P53344 381 aa8.23□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C SUV3P32580 737 aa8.22□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C ECM32P32644 1121 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C BUD16P39988 312 aa8.22□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C PTK2P47116 818 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C GAD1Q04792 585 aa8.22□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C YOL075CQ08234 1294 aa8.22□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C PRR1P28708 518 aa8.22□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C PAN5P38787 379 aa8.22□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C RBL2P48606 106 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C CGR1P53188 120 aa8.22□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C IST1P53843 298 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C ULP1Q02724 621 aa8.22□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C PTC5Q12511 572 aa8.22□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C PDR1P12383 1068 aa8.22□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C COY1P34237 679 aa8.22□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C EXO84P38261 753 aa8.22□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C PEA2P40091 420 aa8.22□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C MRPS18P42847 217 aa8.22□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C EFM5P53200 248 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C RPL6AQ02326 176 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C KRE28Q04431 385 aa8.22□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C DAL2P25335 343 aa8.22□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C HUL4P40985 892 aa8.22□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C NUT1P53114 1132 aa8.22□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C BET4Q00618 327 aa8.22□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C YMR111CQ04461 462 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C MCR1P36060 302 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C HEK2P38199 381 aaKnown RBP RIP-Chip data8.21□□□□□ -1.09not detected
YRF1-7YPL283C NGG1P32494 702 aa8.21□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C URA8P38627 578 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C TAF6P53040 516 aa8.21□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C ERV41Q04651 352 aa8.21□□□□□ -1.09
YRF1-7YPL283C ARG4P04076 463 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C DBP3P20447 523 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C SSP120P39931 234 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C FIS1P40515 155 aa8.21□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C MRM2P53123 320 aa8.21□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C VPS5Q92331 675 aa8.21□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C CIT2P08679 460 aa8.21□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C SEC15P22224 910 aa8.21□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C ATP7P30902 174 aa8.21□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C GCD11P32481 527 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C XDJ1P39102 459 aa8.21□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C HEM2P05373 342 aa8.21□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C YCL068CP25593 260 aa8.21□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C PHO88P38264 188 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C MUB1Q03162 620 aa8.21□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C SHE9Q04172 456 aa8.21□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C PYC1P11154 1178 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C SRV2P17555 526 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C HSP60P19882 572 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C STV1P37296 890 aa8.2□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C TFB3Q03290 321 aa8.2□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C YML083CQ04526 418 aa8.2□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C DON1Q05610 365 aa8.2□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C TGL5Q12043 749 aa8.2□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C UBP3Q01477 912 aaKnown RBP RIP-Chip data8.2□□□□□ -1.1not detected
YRF1-7YPL283C SXM1Q04175 944 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C TMA64Q04600 565 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C PSY4P38193 441 aa8.2□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C YHL050CP38721 697 aa8.2□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C PPR1P07272 904 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C DIA4P38705 446 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C APE4P38821 490 aa8.2□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C STN1P38960 494 aa8.2□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C ARH1P48360 493 aa8.2□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C DBP10Q12389 995 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C SEC63P14906 663 aa8.19□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C URA10P30402 227 aa8.19□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C SRB2P34162 210 aa8.19□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C CDC34P14682 295 aa8.19□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C RRT12P25381 491 aa8.19□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C MRPL40P36534 297 aa8.19□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C VAC8P39968 578 aa8.19□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C ABD1P32783 436 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C TGL4P36165 910 aa8.19□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C PCA1P38360 1216 aa8.19□□□□□ -1.1
YRF1-7YPL283C SLX8P40072 274 aa8.19□□□□□ -1.1
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