RNA–Protein interactions for RNA: YOL077C

BRX1, Transcript of Nucleolar protein, yeast

Gene BRX1, Length 876 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BRX1	YOL077C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
BRX1	YOL077C	MLH3	Q12083	715 aa		4.25	□□□□□ -1.73
BRX1	YOL077C	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
BRX1	YOL077C	SWI6	P09959	803 aa		4.24	□□□□□ -1.73
BRX1	YOL077C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
BRX1	YOL077C	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
BRX1	YOL077C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
BRX1	YOL077C	NTH1	P32356	751 aa		4.24	□□□□□ -1.73
BRX1	YOL077C	GLG1	P36143	616 aa		4.24	□□□□□ -1.73
BRX1	YOL077C	DUN1	P39009	513 aa		4.24	□□□□□ -1.73
BRX1	YOL077C	YIL077C	P40508	320 aa		4.24	□□□□□ -1.73
BRX1	YOL077C	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
BRX1	YOL077C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
BRX1	YOL077C	GPG1	P53130	126 aa		4.24	□□□□□ -1.73
BRX1	YOL077C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
BRX1	YOL077C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
BRX1	YOL077C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
BRX1	YOL077C	BDH2	P39713	417 aa		4.23	□□□□□ -1.73
BRX1	YOL077C	PXA1	P41909	870 aa		4.23	□□□□□ -1.73
BRX1	YOL077C	PPN1	Q04119	674 aa		4.23	□□□□□ -1.73
BRX1	YOL077C	YPS7	Q06325	596 aa		4.23	□□□□□ -1.73
BRX1	YOL077C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
BRX1	YOL077C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.23	□□□□□ -1.73
BRX1	YOL077C	OAF3	P36023	863 aa		4.22	□□□□□ -1.73
BRX1	YOL077C	COS111	P38308	924 aa		4.22	□□□□□ -1.73
BRX1	YOL077C	TDP1	P38319	544 aa		4.22	□□□□□ -1.73
BRX1	YOL077C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
BRX1	YOL077C	HXT7	P39004	570 aa		4.22	□□□□□ -1.73
BRX1	YOL077C	UBP12	P39538	1254 aa		4.22	□□□□□ -1.73
BRX1	YOL077C	YEN1	P40028	759 aa		4.22	□□□□□ -1.73
BRX1	YOL077C	RFX1	P48743	811 aa		4.22	□□□□□ -1.73
BRX1	YOL077C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
BRX1	YOL077C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
BRX1	YOL077C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	SEC6	P32844	805 aa		4.21	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	MPS3	P47069	682 aa		4.21	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	YGR151C	P53287	111 aa		4.21	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	YDL086W	Q07505	273 aa		4.21	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	HFI1	Q12060	488 aa		4.21	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	TAF3	Q12297	353 aa		4.21	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	TSR4	P25040	408 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	FUB1	P25659	250 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	SET3	P36124	751 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	BUD8	P41698	603 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	SPO1	P53541	631 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	YFT2	Q06676	274 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.2	□□□□□ -1.74	not detected
BRX1	YOL077C	RMP1	Q12530	201 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	APM4	Q99186	491 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	IME1	P21190	360 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	KCC4	P25389	1037 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	YPT7	P32939	208 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	GMH1	P36125	273 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	APL3	P38065	1025 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	CTP1	P38152	299 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	KHA1	P40309	873 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	YIL166C	P40445	542 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	TAF4	P50105	388 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	SPC98	P53540	846 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	STP4	Q07351	490 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	TRE2	Q08693	809 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	SPO11	P23179	398 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	GRX4	P32642	244 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	FAT1	P38225	669 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	VID28	P40547	921 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	IES1	P43579	692 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	TAH11	P47112	604 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	NSE5	Q03718	556 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	RPN13	O13563	156 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	PPZ2	P33329	710 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	UBS1	P38290	277 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	YHR033W	P38690	423 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	NMA2	P53204	395 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	DIP5	P53388	608 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	YPR027C	Q12079	277 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	AEP2	P22136	580 aa		4.16	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	DGR2	P32330	852 aa		4.16	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	LAM4	P38800	1345 aa		4.16	□□□□□ -1.74
BRX1	YOL077C	PRE4	P30657	266 aa		4.15	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	DAL3	P32459	195 aa		4.15	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	EUG1	P32474	517 aa		4.15	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	ELF1	P36053	145 aa		4.15	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	FDC1	Q03034	503 aa		4.15	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	SKY1	Q03656	742 aa		4.15	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	UFO1	Q04511	668 aa		4.15	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	RKI1	Q12189	258 aa		4.15	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	SUT2	Q12286	268 aa		4.15	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	CDC26	P14724	124 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.14	□□□□□ -1.75	not detected
BRX1	YOL077C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75

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