RNA–Protein interactions for RNA: YHR195W

NVJ1, Transcript of Nuclear envelope protein, yeast

Gene NVJ1, Length 966 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NVJ1	YHR195W	CDA2	Q06703	312 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	SOD2	P00447	233 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	PHO81	P17442	1178 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.75	□□□□□ -1.49	not detected
NVJ1	YHR195W	PTH2	P34222	208 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	YHR033W	P38690	423 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	BUD8	P41698	603 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	FKH2	P41813	862 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	HIM1	Q06674	414 aa		5.75	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	HOP1	P20050	605 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	TAF4	P50105	388 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	YDL121C	Q07541	149 aa		5.74	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	DBF20	P32328	564 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	TOD6	P34219	525 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	LST4	P34239	828 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	ACA1	P39970	489 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	PXA1	P41909	870 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	RIM8	P53179	542 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	NSE5	Q03718	556 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	HLR1	Q04429	423 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	HIF1	Q12373	385 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	ARP7	Q12406	477 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	TGL1	P34163	548 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	SDS22	P36047	338 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	GET2	P40056	285 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	SAP185	P40856	1058 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	BIT61	P47041	543 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	TEP1	P53916	434 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	MCH5	Q08777	521 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	LAS17	Q12446	633 aa		5.72	□□□□□ -1.49
NVJ1	YHR195W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	EXO84	P38261	753 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	MTL1	P53214	551 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	PPN1	Q04119	674 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	VPS5	Q92331	675 aa		5.71	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	ADH4	P10127	382 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	YPT7	P32939	208 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	LYS9	P38999	446 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	IMA5	P40884	581 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	MAD3	P47074	515 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	MNT2	P53059	558 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	ERG5	P54781	538 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	ENB1	Q08299	606 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	POM34	Q12445	299 aa		5.7	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	CBP3	P21560	335 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	KIN82	P25341	720 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	MSH1	P25846	959 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	APM3	P38153	483 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	SWD1	P39706	426 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	PRM2	P40534	656 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	ERR3	P42222	437 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	SPO1	P53541	631 aa		5.69	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	HMG2	P12684	1045 aa		5.68	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.68	□□□□□ -1.5	not detected
NVJ1	YHR195W	SEC15	P22224	910 aa		5.68	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	PRE4	P30657	266 aa		5.68	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	MTC7	P32633	139 aa		5.68	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	YIR042C	P40586	236 aa		5.68	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	MAD2	P40958	196 aa		5.68	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	PSR2	Q07949	397 aa		5.68	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	NKP1	Q12493	238 aa		5.68	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	ATG11	Q12527	1178 aa		5.68	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	MET3	P08536	511 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	MSM1	P22438	575 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	STE11	P23561	717 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	FMO1	P38866	432 aa		5.67	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
NVJ1	YHR195W	MUP1	P50276	574 aa		5.67	□□□□□ -1.5

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