RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W ATG23Q06671 453 aa9.39□□□□□ -0.91
DDI1YER143W TFB4Q12004 338 aa9.39□□□□□ -0.91
DDI1YER143W DBF4P32325 704 aa9.38□□□□□ -0.91
DDI1YER143W GYP6P32806 458 aa9.38□□□□□ -0.91
DDI1YER143W CBR1P38626 284 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
DDI1YER143W DSE1P40077 573 aa9.38□□□□□ -0.91
DDI1YER143W MAD1P40957 749 aa9.38□□□□□ -0.91
DDI1YER143W POL31P46957 487 aa9.38□□□□□ -0.91
DDI1YER143W FOL2P51601 243 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
DDI1YER143W RIM8P53179 542 aa9.38□□□□□ -0.91
DDI1YER143W SLG1P54867 378 aa9.38□□□□□ -0.91
DDI1YER143W STP1Q00947 519 aa9.38□□□□□ -0.91
DDI1YER143W ECI1Q05871 280 aa9.38□□□□□ -0.91
DDI1YER143W MAG2Q06436 670 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
DDI1YER143W TRE1Q08919 783 aa9.38□□□□□ -0.91
DDI1YER143W NOP58Q12499 511 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
DDI1YER143W RPO26P20435 155 aa9.37□□□□□ -0.91
DDI1YER143W CAD1P24813 409 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
DDI1YER143W ABD1P32783 436 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
DDI1YER143W CNS1P33313 385 aa9.37□□□□□ -0.91
DDI1YER143W NOP4P37838 685 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
DDI1YER143W TBS1P38114 1094 aa9.37□□□□□ -0.91
DDI1YER143W YBL036CP38197 257 aa9.37□□□□□ -0.91
DDI1YER143W MMS21P38632 267 aa9.37□□□□□ -0.91
DDI1YER143W QNS1P38795 714 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
DDI1YER143W DMA1P38823 416 aa9.37□□□□□ -0.91
DDI1YER143W PMC1P38929 1173 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
DDI1YER143W CCT4P39078 528 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
DDI1YER143W SNZ3P43545 298 aa9.37□□□□□ -0.91
DDI1YER143W HOP2P53187 214 aa9.37□□□□□ -0.91
DDI1YER143W SNZ2P53824 298 aa9.37□□□□□ -0.91
DDI1YER143W YMR187CQ03236 431 aa9.37□□□□□ -0.91
DDI1YER143W RCR2Q03446 210 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
DDI1YER143W TDA9Q04545 1251 aa9.37□□□□□ -0.91
DDI1YER143W NOP6Q07623 225 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
DDI1YER143W PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data9.37□□□□□ -0.91not detected
DDI1YER143W DIS3Q08162 1001 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
DDI1YER143W VPS54Q12071 889 aa9.37□□□□□ -0.91
DDI1YER143W FRE1P32791 686 aa9.36□□□□□ -0.91
DDI1YER143W YBL055CP34220 418 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
DDI1YER143W ABZ1P37254 787 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
DDI1YER143W GEM1P39722 662 aa9.36□□□□□ -0.91
DDI1YER143W TMN3P40071 706 aa9.36□□□□□ -0.91
DDI1YER143W SPO74P45819 413 aa9.36□□□□□ -0.91
DDI1YER143W RPC17P47076 161 aa9.36□□□□□ -0.91
DDI1YER143W TIF35Q04067 274 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
DDI1YER143W UFO1Q04511 668 aa9.36□□□□□ -0.91
DDI1YER143W YOR059CQ08448 450 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
DDI1YER143W NUR1Q12066 484 aa9.36□□□□□ -0.91
DDI1YER143W UBR2Q07963 1872 aa9.36□□□□□ -0.91
DDI1YER143W YLR422WQ06409 1932 aa9.35□□□□□ -0.91
DDI1YER143W GAL80P04387 435 aa9.35□□□□□ -0.91
DDI1YER143W KAR3P17119 729 aa9.35□□□□□ -0.91
DDI1YER143W SFL1P20134 766 aa9.35□□□□□ -0.91
DDI1YER143W VMA4P22203 233 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
DDI1YER143W KDX1P36005 433 aa9.35□□□□□ -0.91
DDI1YER143W END3P39013 349 aa9.35□□□□□ -0.91
DDI1YER143W FIR1P40020 876 aa9.35□□□□□ -0.91
DDI1YER143W SPC98P53540 846 aa9.35□□□□□ -0.91
DDI1YER143W MTG1Q03151 367 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
DDI1YER143W ARO80Q04052 950 aa9.35□□□□□ -0.91
DDI1YER143W AIM41Q12032 185 aa9.35□□□□□ -0.91
DDI1YER143W YRR1Q12172 810 aa9.35□□□□□ -0.91
DDI1YER143W PKH2Q12236 1081 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
DDI1YER143W ZRT2Q12436 422 aa9.35□□□□□ -0.91
DDI1YER143W JIP3O13555 125 aa9.34□□□□□ -0.91
DDI1YER143W RAD10P06838 210 aa9.34□□□□□ -0.91
DDI1YER143W PUT4P15380 627 aa9.34□□□□□ -0.91
DDI1YER143W VPS3P23643 1011 aa9.34□□□□□ -0.91
DDI1YER143W GAC1P28006 793 aa9.34□□□□□ -0.91
DDI1YER143W SLA2P33338 968 aa9.34□□□□□ -0.91
DDI1YER143W SEG2P34250 1132 aa9.34□□□□□ -0.91
DDI1YER143W OPT1P40897 799 aa9.34□□□□□ -0.91
DDI1YER143W YFL040WP43562 540 aa9.34□□□□□ -0.91
DDI1YER143W MUB1Q03162 620 aa9.34□□□□□ -0.91
DDI1YER143W SXM1Q04175 944 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
DDI1YER143W EMP46Q12396 444 aa9.34□□□□□ -0.91
DDI1YER143W CIT2P08679 460 aa9.33□□□□□ -0.92
DDI1YER143W PRP9P19736 530 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
DDI1YER143W PEP7P32609 515 aa9.33□□□□□ -0.92
DDI1YER143W YBR284WP38150 797 aa9.33□□□□□ -0.92
DDI1YER143W RPT2P40327 437 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
DDI1YER143W NMD5P46970 1048 aa9.33□□□□□ -0.92
DDI1YER143W NOG2P53742 486 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
DDI1YER143W YNL011CP53980 444 aa9.33□□□□□ -0.92
DDI1YER143W YPL062WQ02781 134 aa9.33□□□□□ -0.92
DDI1YER143W IVY1Q04934 453 aa9.33□□□□□ -0.92
DDI1YER143W ESC8Q08119 714 aa9.33□□□□□ -0.92
DDI1YER143W GYP1Q08484 637 aa9.33□□□□□ -0.92
DDI1YER143W REC8Q12188 680 aa9.33□□□□□ -0.92
DDI1YER143W HAP2P06774 265 aa9.32□□□□□ -0.92
DDI1YER143W TRX1P22217 103 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
DDI1YER143W SEC1P30619 724 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
DDI1YER143W GCD6P32501 712 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
DDI1YER143W MRPL7P36519 292 aa9.32□□□□□ -0.92
DDI1YER143W PCM1P38628 557 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
DDI1YER143W APM2P38700 605 aa9.32□□□□□ -0.92
DDI1YER143W YHR202WP38887 602 aa9.32□□□□□ -0.92
DDI1YER143W SIP5P40210 489 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
DDI1YER143W YNL320WP42840 284 aa9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 28.1 ms