RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617399.1

NBR1-208, Transcript of NBR1, autophagy cargo receptor, human

Gene NBR1, Length 63 nt, Biotype misc RNA, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NBR1-208	ENST00000617399	HMX2	A2RU54	273 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NBR1-208	ENST00000617399	GSC2	O15499	205 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NBR1-208	ENST00000617399	ARL4D	P49703	201 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NBR1-208	ENST00000617399	IKBKE	Q14164	716 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NBR1-208	ENST00000617399	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NBR1-208	ENST00000617399	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NBR1-208	ENST00000617399	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NBR1-208	ENST00000617399	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		7.03	□□□□□ -1.28
NBR1-208	ENST00000617399	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	MED26	O95402	600 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	TGFB1	P01137	390 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	CD97	P48960	835 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	NFIA	Q12857	509 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	UST	Q9Y2C2	406 aa		7.02	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	METTL12	A8MUP2	240 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	BMP3	P12645	472 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	SERPINB4	P48594	390 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	FDX2	Q6P4F2	183 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		7.01	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	ICMT	O60725	284 aa		7	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	ECM1	Q16610	540 aa		7	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	RNF43	Q68DV7	783 aa		7	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	BEND4	Q6ZU67	534 aa		7	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		7	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	USP26	Q9BXU7	913 aa		7	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		7	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		7	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	MEGF11	A6BM72	1044 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399		H3BRB1	525 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	DLGAP3	O95886	979 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		6.99	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	COBL	O75128	1261 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		6.98	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399		A0A1W2PP55	124 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	PRR19	A6NJB7	356 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	GSTM4	Q03013	218 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	SGO2	Q562F6	1265 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		6.97	□□□□□ -1.29
NBR1-208	ENST00000617399		A0A096LPE4	126 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NBR1-208	ENST00000617399		A0A1W2PPZ6	126 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NBR1-208	ENST00000617399	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
NBR1-208	ENST00000617399	TIAF1	O95411	115 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NBR1-208	ENST00000617399	GRIA4	P48058	902 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NBR1-208	ENST00000617399	ARHGAP4	P98171	946 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NBR1-208	ENST00000617399	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NBR1-208	ENST00000617399	CCNJL	Q8IV13	435 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NBR1-208	ENST00000617399	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
NBR1-208	ENST00000617399	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NBR1-208	ENST00000617399	TCF12	Q99081	682 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NBR1-208	ENST00000617399	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NBR1-208	ENST00000617399	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		6.96	□□□□□ -1.3
NBR1-208	ENST00000617399	DRD2	P14416	443 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NBR1-208	ENST00000617399	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
NBR1-208	ENST00000617399	PCDH1	Q08174	1060 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NBR1-208	ENST00000617399	ARID3A	Q99856	593 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NBR1-208	ENST00000617399	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NBR1-208	ENST00000617399	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		6.95	□□□□□ -1.3
NBR1-208	ENST00000617399	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NBR1-208	ENST00000617399	RXRB	P28702	533 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NBR1-208	ENST00000617399	ORC1	Q13415	861 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NBR1-208	ENST00000617399	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NBR1-208	ENST00000617399	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
NBR1-208	ENST00000617399	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		6.94	□□□□□ -1.3
NBR1-208	ENST00000617399	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
NBR1-208	ENST00000617399	WDR64	B1ANS9	1081 aa		6.93	□□□□□ -1.3
NBR1-208	ENST00000617399	NDUFB5	O43674	189 aa		6.93	□□□□□ -1.3
NBR1-208	ENST00000617399	ADAMTS4	O75173	837 aa		6.93	□□□□□ -1.3
NBR1-208	ENST00000617399	CTSB	P07858	339 aa		6.93	□□□□□ -1.3
NBR1-208	ENST00000617399	SPINK2	P20155	84 aa		6.93	□□□□□ -1.3
NBR1-208	ENST00000617399	GRIK1	P39086	918 aa		6.93	□□□□□ -1.3
NBR1-208	ENST00000617399	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
NBR1-208	ENST00000617399	FAM129B	Q96TA1	746 aa		6.93	□□□□□ -1.3
NBR1-208	ENST00000617399	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NBR1-208	ENST00000617399	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NBR1-208	ENST00000617399	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NBR1-208	ENST00000617399	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	6.92	□□□□□ -1.3
NBR1-208	ENST00000617399	NPHS2	Q9NP85	383 aa		6.92	□□□□□ -1.3
NBR1-208	ENST00000617399	F13B	P05160	661 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NBR1-208	ENST00000617399	MAOB	P27338	520 aa		6.91	□□□□□ -1.3
NBR1-208	ENST00000617399	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	6.91	□□□□□ -1.3

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