RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600953.3

LINC01435-211, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1435, humanhuman

TSL 5

Gene LINC01435, Length 634 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01435-211ENST00000600953 CES1P23141 567 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC01435-211ENST00000600953 DUOXA2Q1HG44 320 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC01435-211ENST00000600953 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC01435-211ENST00000600953 MUC3BQ9H195 1237 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC01435-211ENST00000600953 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
LINC01435-211ENST00000600953 USTQ9Y2C2 406 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC01435-211ENST00000600953 HMX2A2RU54 273 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC01435-211ENST00000600953 ADAMTS4O75173 837 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC01435-211ENST00000600953 TGFB1P01137 390 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC01435-211ENST00000600953 NLRP12P59046 1061 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC01435-211ENST00000600953 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC01435-211ENST00000600953 SLC7A3Q8WY07 619 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC01435-211ENST00000600953 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
LINC01435-211ENST00000600953 LATS2Q9NRM7 1088 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC01435-211ENST00000600953 CCDC87Q9NVE4 849 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC01435-211ENST00000600953 HECW2Q9P2P5 1572 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC01435-211ENST00000600953 LMTK3Q96Q04 1460 aa6.72□□□□□ -1.33
LINC01435-211ENST00000600953 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 FZD6O60353 706 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 PTPRAP18433 802 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 TRIM42Q8IWZ5 723 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 NXPE3Q969Y0 559 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 SEC31BQ9NQW1 1179 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 STOML1Q9UBI4 398 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 SOX13Q9UN79 622 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 PRDM2Q13029 1718 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 SYNJ1O43426 1573 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 DLGAP3O95886 979 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 PREPP48147 710 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 VN1R5Q7Z5H4 357 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 SHISA5Q8N114 240 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 KLHL23Q8NBE8 558 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 OSMRQ99650 979 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 ERCC6L2Q5T890 1561 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 METTL12A8MUP2 240 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 H3BRJ5 948 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 TNFRSF21O75509 655 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 IGLV1-40P01703 118 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 NPR3P17342 541 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 FBXO41Q8TF61 875 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 CD97P48960 835 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 ECM1Q16610 540 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 PCMTD2Q9NV79 361 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 TSPOAP1O95153 1857 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 PRR19A6NJB7 356 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 PDE4CQ08493 712 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 AAMPQ13685 434 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 FAM117BQ6P1L5 589 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 MYRFLQ96LU7 910 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 KDM6BO15054 1643 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 DHX15O43143 795 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 ABL1P00519 1130 aa6.66□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 BMP3P12645 472 aa6.66□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 PIP4K2BP78356 416 aa6.66□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 NFIAQ12857 509 aa6.66□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 FAM20CQ8IXL6 584 aa6.66□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 PHACTR2O75167 634 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 USPL1Q5W0Q7 1092 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 ASAP3Q8TDY4 903 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 CEP41Q9BYV8 373 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 OSGEPQ9NPF4 335 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC01435-211ENST00000600953 ADGRL1O94910 1474 aa6.65□□□□□ -1.35
LINC01435-211ENST00000600953 DNMBPQ6XZF7 1577 aa6.65□□□□□ -1.35
LINC01435-211ENST00000600953 BRD1O95696 1058 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC01435-211ENST00000600953 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
LINC01435-211ENST00000600953 CTSBP07858 339 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC01435-211ENST00000600953 DRD2P14416 443 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC01435-211ENST00000600953 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
LINC01435-211ENST00000600953 CABP4P57796 275 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC01435-211ENST00000600953 SGO2Q562F6 1265 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC01435-211ENST00000600953 RNF43Q68DV7 783 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC01435-211ENST00000600953 AEBP1Q8IUX7 1158 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC01435-211ENST00000600953 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC01435-211ENST00000600953 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
LINC01435-211ENST00000600953 PCSK2P16519 638 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC01435-211ENST00000600953 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC01435-211ENST00000600953 IKBKEQ14164 716 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC01435-211ENST00000600953 SPRED3Q2MJR0 410 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC01435-211ENST00000600953 ALKBH2Q6NS38 261 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC01435-211ENST00000600953 BEND4Q6ZU67 534 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC01435-211ENST00000600953 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC01435-211ENST00000600953 SHKBP1Q8TBC3 707 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC01435-211ENST00000600953 DCAF11Q8TEB1 546 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.3 ms