RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 DHX15O43143 795 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 PHACTR2O75167 634 aa8.63□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 MAPK1P28482 360 aa8.63□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 PIP4K2BP78356 416 aa8.63□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 OSMRQ99650 979 aa8.63□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 RBCK1Q9BYM8 510 aa8.63□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 STOML1Q9UBI4 398 aa8.63□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 BRPF3Q9ULD4 1205 aa8.63□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 NDUFB5O43674 189 aa8.62□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 TNFRSF21O75509 655 aa8.62□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 NLRP12P59046 1061 aa8.62□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 RGS22Q8NE09 1264 aa8.62□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 CITED4Q96RK1 184 aa8.62□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 ARMC10Q8N2F6 343 aa8.61□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 WNT8BQ93098 351 aa8.61□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 EDN3P14138 238 aa8.6□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 USP5P45974 858 aa8.6□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 EHHADHQ08426 723 aa8.6□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 HGSNATQ68CP4 663 aa8.6□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 SNX29Q8TEQ0 813 aa8.6□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 ASB16Q96NS5 453 aa8.6□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa8.6□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 OSGEPQ9NPF4 335 aa8.6□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 SOX13Q9UN79 622 aa8.6□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 SART1O43290 800 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 ERCC3P19447 782 aa8.59□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 SSTR4P31391 388 aa8.59□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 ARL4DP49703 201 aa8.59□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 SLC51AQ86UW1 340 aa8.59□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 GJD3Q8N144 294 aa8.59□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 ASAP3Q8TDY4 903 aa8.59□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 NXPE3Q969Y0 559 aa8.59□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 PCMTD2Q9NV79 361 aa8.59□□□□□ -1.03
TRDN-204ENST00000542443 IGLV1-40P01703 118 aa8.58□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 C19orf57Q0VDD7 668 aa8.58□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 UVSSAQ2YD98 709 aa8.58□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 TMC7Q7Z402 723 aa8.58□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 BSNDQ8WZ55 320 aa8.58□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa8.58□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 FAM129BQ96TA1 746 aa8.58□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 RUSC1Q9BVN2 902 aa8.58□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 LATS2Q9NRM7 1088 aa8.58□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 ANKRD33BA6NCL7 494 aa8.57□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 GSC2O15499 205 aa8.57□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 IGHA2P01877 340 aa8.57□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 IKBKEQ14164 716 aa8.57□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 TRIM42Q8IWZ5 723 aa8.57□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 MYRFLQ96LU7 910 aa8.57□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 C7orf69Q9H7B7 122 aa8.57□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa8.57□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 HMX2A2RU54 273 aa8.56□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 PDE3BQ13370 1112 aa8.56□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 ANKRD34AQ69YU3 496 aa8.56□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 FDX2Q6P4F2 183 aa8.56□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 DMRTB1Q96MA1 342 aa8.56□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 USP26Q9BXU7 913 aa8.56□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 RNF208Q9H0X6 261 aa8.56□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 BMP3P12645 472 aa8.55□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 PREPP48147 710 aa8.55□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 VN1R5Q7Z5H4 357 aa8.55□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 NPAS4Q8IUM7 802 aa8.55□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa8.55□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 KCNF1Q9H3M0 494 aa8.55□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 GPR182O15218 404 aa8.54□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 TREHO43280 583 aa8.54□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 TGFB1P01137 390 aa8.54□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 NFIAQ12857 509 aa8.54□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 DSC3Q14574 896 aa8.54□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 FAM20CQ8IXL6 584 aa8.54□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 TMC1Q8TDI8 760 aa8.54□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa8.54□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 GAS2O43903 313 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
TRDN-204ENST00000542443 METTL12A8MUP2 240 aa8.52□□□□□ -1.05
TRDN-204ENST00000542443 COL19A1Q14993 1142 aa8.52□□□□□ -1.05
TRDN-204ENST00000542443 RNF43Q68DV7 783 aa8.52□□□□□ -1.05
TRDN-204ENST00000542443 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
TRDN-204ENST00000542443 BEND4Q6ZU67 534 aa8.52□□□□□ -1.05
TRDN-204ENST00000542443 MED26O95402 600 aa8.51□□□□□ -1.05
TRDN-204ENST00000542443 CD97P48960 835 aa8.51□□□□□ -1.05
TRDN-204ENST00000542443 GSTM4Q03013 218 aa8.51□□□□□ -1.05
TRDN-204ENST00000542443 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
TRDN-204ENST00000542443 NUTM2GQ5VZR2 741 aa8.51□□□□□ -1.05
TRDN-204ENST00000542443 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa8.51□□□□□ -1.05
TRDN-204ENST00000542443 CLEC10AQ8IUN9 316 aa8.51□□□□□ -1.05
TRDN-204ENST00000542443 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
TRDN-204ENST00000542443 FAM83CQ9BQN1 747 aa8.51□□□□□ -1.05
TRDN-204ENST00000542443 DBNDD2Q9BQY9 259 aa8.51□□□□□ -1.05
TRDN-204ENST00000542443 COBLO75128 1261 aa8.5□□□□□ -1.05
TRDN-204ENST00000542443 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
TRDN-204ENST00000542443 PLCB3Q01970 1234 aa8.5□□□□□ -1.05
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