RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512247.5

LNX1-208, Transcript of ligand of numb-protein X 1, human

TSL 3

Gene LNX1, Length 603 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LNX1-208	ENST00000512247	KRT24	Q2M2I5	525 aa		10.88	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		10.88	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	COA1	Q9GZY4	146 aa		10.88	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	ELP3	Q9H9T3	547 aa		10.88	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	VEZT	Q9HBM0	779 aa		10.88	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	COL4A1	P02462	1669 aa		10.88	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	PDE8A	O60658	829 aa		10.87	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	MMP14	P50281	582 aa		10.87	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	GTF2I	P78347	998 aa		10.87	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	MAP3K11	Q16584	847 aa		10.87	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		10.87	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		10.87	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	OPTN	Q96CV9	577 aa		10.87	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		10.87	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	UNCX	A6NJT0	531 aa		10.86	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247		F8W031	263 aa	Predicted RBP	10.86	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	CHL1	O00533	1208 aa		10.86	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	ZNF853	P0CG23	659 aa		10.86	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	10.86	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	LRCH3	Q96II8	777 aa		10.86	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	MYD88	Q99836	296 aa		10.86	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	10.86	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		10.86	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	COL6A3	P12111	3177 aa		10.86	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	MED23	Q9ULK4	1368 aa		10.86	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		10.85	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	10.85	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	MTFR1	Q15390	333 aa		10.85	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	CCL15	Q16663	113 aa		10.85	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		10.85	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		10.85	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	HYPK	Q9NX55	129 aa		10.85	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		10.85	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	NEFL	P07196	543 aa		10.84	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	HOXB7	P09629	217 aa		10.84	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	KCNJ4	P48050	445 aa		10.84	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	GTF2A2	P52657	109 aa		10.84	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		10.84	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		10.84	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		10.84	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		10.84	□□□□□ -0.67
LNX1-208	ENST00000512247	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	EVI5	O60447	810 aa		10.83	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	MS4A1	P11836	297 aa		10.83	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	RASA3	Q14644	834 aa		10.83	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		10.83	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	CFAP100	Q494V2	611 aa		10.83	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		10.83	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	DEFB123	Q8N688	67 aa		10.83	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	RAET1E	Q8TD07	263 aa		10.83	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		10.83	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	SHISA4	Q96DD7	197 aa		10.83	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		10.83	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		10.83	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	RNF208	Q9H0X6	261 aa		10.83	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	STAP2	Q9UGK3	403 aa		10.83	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		10.83	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		10.83	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	PRMT2	P55345	433 aa		10.82	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	CTSW	P56202	376 aa		10.82	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		10.82	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	PRO3102	Q9H379	93 aa		10.82	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	MBIP	Q9NS73	344 aa		10.82	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		10.82	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	CSAD	Q9Y600	493 aa		10.82	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		10.82	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247		A0A1W2PPC1	479 aa		10.81	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		10.81	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	TLR2	O60603	784 aa		10.81	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	GNRH1	P01148	92 aa		10.81	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	SPDYE6	P0CI01	402 aa		10.81	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	CCL5	P13501	91 aa		10.81	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	KLRK1	P26718	216 aa		10.81	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	HOXD10	P28358	340 aa		10.81	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	GRK4	P32298	578 aa		10.81	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	GJA8	P48165	433 aa		10.81	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	TRIM47	Q96LD4	638 aa		10.81	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	GREM2	Q9H772	168 aa		10.81	□□□□□ -0.68
LNX1-208	ENST00000512247	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68

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