RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 TSHZ3Q63HK5 1081 aa8.71□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 PGBD3Q8N328 593 aa8.71□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa8.71□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 ANKRD42Q8N9B4 389 aa8.71□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF511Q8NB15 262 aa8.71□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 BAP1Q92560 729 aa8.71□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 SMC3Q9UQE7 1217 aa8.71□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa8.71□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 WASF2Q9Y6W5 498 aa8.71□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 PSMA3P25788 255 aa8.7□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 CNGA1P29973 690 aa8.7□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 NUCB1Q02818 461 aa8.7□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 CBLBQ13191 982 aa8.7□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 QPCTQ16769 361 aa8.7□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 LINC01559Q495D7 138 aa8.7□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 ANO1Q5XXA6 986 aa8.7□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 C16orf86Q6ZW13 317 aa8.7□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 SIX5Q8N196 739 aa8.7□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 HELQQ8TDG4 1101 aa8.7□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 MPP4Q96JB8 637 aa8.7□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 SCLT1Q96NL6 688 aa8.7□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 DEPDC7Q96QD5 511 aa8.7□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 TLL2Q9Y6L7 1015 aa8.7□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 TRIM64CA6NLI5 447 aa8.69□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 USP17L5A8MUK1 530 aa8.69□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 TREHO43280 583 aa8.69□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 VARSP26640 1264 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 GJA8P48165 433 aa8.69□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa8.69□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 DAAM2Q86T65 1068 aa8.69□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 KIAA0825Q8IV33 1275 aa8.69□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 SPICE1Q8N0Z3 855 aa8.69□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 FAM210AQ96ND0 272 aa8.69□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 HERPUD2Q9BSE4 406 aa8.69□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 SNTG2Q9NY99 539 aa8.69□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 WASHC2AQ641Q2 1341 aa8.69□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 KAT6BQ8WYB5 2073 aa8.68□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 PES1O00541 588 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 SCNN1AP37088 669 aa8.68□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 TRIM29Q14134 588 aa8.68□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 WDR45BQ5MNZ6 344 aa8.68□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 LYPD8Q6UX82 237 aa8.68□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 TMC7Q7Z402 723 aa8.68□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 BRSK2Q8IWQ3 736 aa8.68□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 NPAS3Q8IXF0 933 aa8.68□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 TRPM4Q8TD43 1214 aa8.68□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 PTPRHQ9HD43 1115 aa8.68□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 RIC8AQ9NPQ8 531 aa8.68□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 LUZP4Q9P127 313 aa8.68□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 CNTN3Q9P232 1028 aa8.68□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 PGAP2Q9UHJ9 254 aa8.68□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 TAGLN3Q9UI15 199 aa8.68□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 MCM8Q9UJA3 840 aa8.68□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 MKL2Q9ULH7 1088 aa8.68□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 MAFFQ9ULX9 164 aa8.68□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 NOD1Q9Y239 953 aa8.68□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 IKBKGQ9Y6K9 419 aa8.68□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 NDUFB5O43674 189 aa8.67□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 SCGB1D2O95969 90 aa8.67□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 SKIP12755 728 aa8.67□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 EIF5P55010 431 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 PLCB3Q01970 1234 aa8.67□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 TMED1Q13445 227 aa8.67□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 TOMM20Q15388 145 aa8.67□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF394Q53GI3 561 aa8.67□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 PPP4R3AQ6IN85 833 aa8.67□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa8.67□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 ATG3Q9NT62 314 aa8.67□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 FAM181BA6NEQ2 426 aa8.66□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 CFAP99D6REC4 459 aa8.66□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 CHL1O00533 1208 aa8.66□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 F12P00748 615 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 RPL17P18621 184 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 TSPAN7P41732 249 aa8.66□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 MAPK8P45983 427 aa8.66□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 RACK1P63244 317 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 SPECC1Q5M775 1068 aa8.66□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 FAM83BQ5T0W9 1011 aa8.66□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 ERAP2Q6P179 960 aa8.66□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 HS2ST1Q7LGA3 356 aa8.66□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 C14orf80Q86SX3 495 aa8.66□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 TTC8Q8TAM2 541 aa8.66□□□□□ -1.02
PDCD4-211ENST00000498367 CITED4Q96RK1 184 aa8.66□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms