RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 PTGS1P23219 599 aa21.44■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa21.44■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 NCOA7Q8NI08 942 aa21.44■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa21.43■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF213O14771 459 aa21.43■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 PIGBQ92521 554 aa21.43■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 SHANK3Q9BYB0 1731 aa21.43■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 FOXP2O15409 715 aa21.43■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 GPAA1O43292 621 aa21.43■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF75DP51815 510 aa21.43■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 STX1AQ16623 288 aa21.43■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 PI16Q6UXB8 463 aa21.43■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 PLA2G4DQ86XP0 818 aa21.43■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa21.43■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa21.42■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 GOLGA8BA8MQT2 603 aa21.42■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 FDPSP14324 419 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 ITGA6P23229 1130 aa21.42■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 GPTP24298 496 aa21.42■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 FAM160A1Q05DH4 1040 aa21.42■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC186Q7Z3E2 898 aa21.42■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 CNNM1Q9NRU3 951 aa21.42■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 CPLX1O14810 134 aa21.41■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa21.41■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 C8orf76Q96K31 380 aa21.41■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 FSIP1Q8NA03 581 aa21.41■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 CDHR2Q9BYE9 1310 aa21.41■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 MYH15Q9Y2K3 1946 aa21.4■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa21.4■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 SYNE4Q8N205 404 aa21.4■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa21.4■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 TRDNQ13061 729 aa21.4■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 TTLL11Q8NHH1 800 aa21.4■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 GREM2Q9H772 168 aa21.4■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 CLIP2Q9UDT6 1046 aa21.4■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa21.39■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 BECN2A8MW95 431 aa21.39■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 MCAMP43121 646 aa21.39■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 HLFQ16534 295 aa21.39■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 NLRP10Q86W26 655 aa21.39■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
SYNE4-204ENST00000465425 RIC1Q4ADV7 1423 aa21.39■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 CTSWP56202 376 aa21.39■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 RTEL1Q9NZ71 1219 aa21.39■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa21.38■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 ENGASEQ8NFI3 743 aa21.38■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 ANO10Q9NW15 660 aa21.38■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 IQCB1Q15051 598 aa21.38■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 PCDHA7Q9UN72 937 aa21.38■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 STK38Q15208 465 aa21.37■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 ADALQ6DHV7 355 aa21.37■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa21.37■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa21.37■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 NRBP1Q9UHY1 535 aa21.37■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 NWD2Q9ULI1 1742 aa21.37■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 WDR19Q8NEZ3 1342 aa21.37■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 ADD2P35612 726 aa21.37■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 ANTXR2P58335 489 aa21.37■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa21.37■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 KCNG4Q8TDN1 519 aa21.37■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 HPS5Q9UPZ3 1129 aa21.37■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 IDH1O75874 414 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 APPP05067 770 aa21.36■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP21.36■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 BRAPQ7Z569 592 aa21.36■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 SDF4Q9BRK5 362 aa21.36■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 ABCA3Q99758 1704 aa21.36■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 CDC25BP30305 580 aa21.35■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 SARM1Q6SZW1 724 aa21.35■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 LINC00301Q8NCQ3 95 aa21.35■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 LRMPQ12912 555 aa21.35■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa21.35■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 CEP57L1Q8IYX8 460 aa21.35■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 POLR3EQ9NVU0 708 aa21.35■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 A0A1W2PQ27 194 aa21.34■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 A0A1W2PQ64 194 aa21.34■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 A0A1W2PQD8 194 aa21.34■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 BTG4Q9NY30 223 aa21.34■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa21.34■■□□□ 1.01
SYNE4-204ENST00000465425 A0A1B0GVL5 298 aa21.34■■□□□ 1.01
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