RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364877.1

RNU6-534P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 534, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-534P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-534P-201ENST00000364877 MYRFLQ96LU7 910 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-534P-201ENST00000364877 LATS2Q9NRM7 1088 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-534P-201ENST00000364877 PCMTD2Q9NV79 361 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-534P-201ENST00000364877 H3BRB1 525 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 PREPP48147 710 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 VN1R5Q7Z5H4 357 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 TRIM42Q8IWZ5 723 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 USP26Q9BXU7 913 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 KCNF1Q9H3M0 494 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 HMX2A2RU54 273 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 BMP3P12645 472 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 NFIAQ12857 509 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 GLYCTKQ8IVS8 523 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 FAM20CQ8IXL6 584 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 EGFL7Q9UHF1 273 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 METTL12A8MUP2 240 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 GAS2O43903 313 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 ICMTO60725 284 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 TGFB1P01137 390 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 SERPINB4P48594 390 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 BRPF3Q9ULD4 1205 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 CD97P48960 835 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 NUTM2GQ5VZR2 741 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 RNF43Q68DV7 783 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 BEND4Q6ZU67 534 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 ARID3AQ99856 593 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 DBNDD2Q9BQY9 259 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 CLEC10AQ8IUN9 316 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 FAM83CQ9BQN1 747 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 MEGF11A6BM72 1044 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 NDUFB5O43674 189 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 COBLO75128 1261 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 GSTM4Q03013 218 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 GALNT12Q8IXK2 581 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 CYP4F12Q9HCS2 524 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-534P-201ENST00000364877 A0A1W2PP55 124 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 RXRBP28702 533 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 GRIK1P39086 918 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 SGO2Q562F6 1265 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 A0A096LPE4 126 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 A0A1W2PPZ6 126 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 MED26O95402 600 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 DLGAP3O95886 979 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 USPL1Q5W0Q7 1092 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 CCNJLQ8IV13 435 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 SHKBP1Q8TBC3 707 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 TIAF1O95411 115 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 NEFLP07196 543 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 GRIA4P48058 902 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 PCDH1Q08174 1060 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 ECM1Q16610 540 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 SPRED3Q2MJR0 410 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 MFSD14AQ96MC6 490 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 SUGCTQ9HAC7 445 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 PRR19A6NJB7 356 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 DRD2P14416 443 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 USP11P51784 963 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 ARHGAP4P98171 946 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 PDE3BQ13370 1112 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 ORC1Q13415 861 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 RETREG2Q8NC44 543 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 TMC1Q8TDI8 760 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 TCF12Q99081 682 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 NPHS2Q9NP85 383 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 WDR64B1ANS9 1081 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 MAOBP27338 520 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 ZNF423Q2M1K9 1284 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 FBXL6Q8N531 539 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 GIMAP7Q8NHV1 300 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 FAM129BQ96TA1 746 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 NRSN2Q9GZP1 204 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 EHD4Q9H223 541 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-534P-201ENST00000364877 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms