RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361368.6

SMURF1-202, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-202ENST00000361368 SNX16P57768 344 aa22.95■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 TUBB4BP68371 445 aa22.95■■□□□ 1.26
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SMURF1-202ENST00000361368 GIMAP6Q6P9H5 292 aa22.95■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 CBX1P83916 185 aa22.94■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 ANO6Q4KMQ2 910 aa22.94■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 BRAPQ7Z569 592 aa22.94■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 CCDC63Q8NA47 563 aa22.94■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 C19orf44Q9H6X5 657 aa22.94■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 HOOK2Q96ED9 719 aa22.94■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 RAD50Q92878 1312 aa22.94■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 RIMBP2O15034 1052 aa22.94■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.94■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 TICAM2Q86XR7 235 aa22.93■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa22.93■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.93■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 SLC8A3P57103 927 aa22.93■■□□□ 1.26
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SMURF1-202ENST00000361368 PICK1Q9NRD5 415 aa22.93■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 PLCD3Q8N3E9 789 aa22.92■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 JAKMIP2Q96AA8 810 aa22.92■■□□□ 1.26
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SMURF1-202ENST00000361368 FAM169AQ9Y6X4 670 aa22.92■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
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SMURF1-202ENST00000361368 F13A1P00488 732 aa22.92■■□□□ 1.26
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SMURF1-202ENST00000361368 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa22.92■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 CERS3Q8IU89 383 aa22.92■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 CCDC65Q8IXS2 484 aa22.92■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 CTAGE9A4FU28 777 aa22.92■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.91■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.261e-6■■■■□ 24.4
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SMURF1-202ENST00000361368 IQUBQ8NA54 791 aa22.91■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 GLT8D2Q9H1C3 349 aa22.91■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 PARP10Q53GL7 1025 aa22.91■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 MIGA1Q8NAN2 632 aa22.91■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.91■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa22.91■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.91■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 NOD1Q9Y239 953 aa22.91■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.91■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.91■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 MAP7D1Q3KQU3 841 aa22.9■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa22.9■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa22.9■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 MAP3K5Q99683 1374 aa22.9■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 WDR44Q5JSH3 913 aa22.9■■□□□ 1.26
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SMURF1-202ENST00000361368 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.9■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 STK24Q9Y6E0 443 aa22.9■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 MCM7P33993 719 aa22.9■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 ARID5AQ03989 594 aa22.9■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 CNBD1Q8NA66 436 aa22.9■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.26
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SMURF1-202ENST00000361368 MTUS1Q9ULD2 1270 aa22.9■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 ODF2LQ9ULJ1 636 aa22.9■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 V9GYY5 206 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 PTGS1P23219 599 aa22.89■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.89■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 ARFGAP3Q9NP61 516 aa22.89■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
SMURF1-202ENST00000361368 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.25
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SMURF1-202ENST00000361368 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.89■■□□□ 1.25
SMURF1-202ENST00000361368 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
SMURF1-202ENST00000361368 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
SMURF1-202ENST00000361368 ALDH3A1P30838 453 aa22.89■■□□□ 1.25
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SMURF1-202ENST00000361368 KIFAP3Q92845 792 aa22.89■■□□□ 1.25
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SMURF1-202ENST00000361368 SYT1P21579 422 aa22.89■■□□□ 1.25
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SMURF1-202ENST00000361368 FNBP1Q96RU3 617 aa22.89■■□□□ 1.25
SMURF1-202ENST00000361368 DACT1Q9NYF0 836 aa22.89■■□□□ 1.25
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SMURF1-202ENST00000361368 CFAP58Q5T655 872 aa22.88■■□□□ 1.25
SMURF1-202ENST00000361368 SV2BQ7L1I2 683 aa22.88■■□□□ 1.25
SMURF1-202ENST00000361368 USP48Q86UV5 1035 aa22.88■■□□□ 1.25
SMURF1-202ENST00000361368 GNPATO15228 680 aa22.88■■□□□ 1.25
SMURF1-202ENST00000361368 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.88■■□□□ 1.25
SMURF1-202ENST00000361368 MAP3K1Q13233 1512 aa22.88■■□□□ 1.25
SMURF1-202ENST00000361368 PLCD1P51178 756 aa22.87■■□□□ 1.25
SMURF1-202ENST00000361368 ANKS4BQ8N8V4 417 aa22.87■■□□□ 1.25
SMURF1-202ENST00000361368 DNAI1Q9UI46 699 aa22.87■■□□□ 1.25
SMURF1-202ENST00000361368 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SMURF1-202ENST00000361368 ATL3Q6DD88 541 aa22.87■■□□□ 1.25
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