RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485943.1

USP40-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 4

Gene USP40, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-216ENST00000485943 THNSL2Q86YJ6 484 aa6.65□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 OR8H2Q8N162 312 aa6.65□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 KIR3DL3Q8N743 410 aa6.65□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 ZNF565Q8N9K5 539 aa6.65□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 PXT1Q8NFP0 134 aa6.65□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 OR13D1Q8NGV5 346 aa6.65□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 OR10K1Q8NGX5 313 aa6.65□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 MUL1Q969V5 352 aa6.65□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 PHF21AQ96BD5 680 aa6.65□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 SDSLQ96GA7 329 aa6.65□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 ZNF714Q96N38 554 aa6.65□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 OR5M11Q96RB7 305 aa6.65□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 SLC6A7Q99884 636 aa6.65□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 PPA2Q9H2U2 334 aa6.65□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 DPAGT1Q9H3H5 408 aa6.65□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 SPACA1Q9HBV2 294 aa6.65□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 HMG20AQ9NP66 347 aa6.65□□□□□ -1.34
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USP40-216ENST00000485943 ACOT13Q9NPJ3 140 aa6.65□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 ABCB10Q9NRK6 738 aa6.65□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 SSR3Q9UNL2 185 aa6.65□□□□□ -1.34
USP40-216ENST00000485943 ST3GAL6Q9Y274 331 aa6.65□□□□□ -1.34
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USP40-216ENST00000485943 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa6.64□□□□□ -1.35
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USP40-216ENST00000485943 CCRL2O00421 344 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 TOR1AO14656 332 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 DENRO43583 198 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 TNFAIP8O95379 198 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 OR2H2O95918 312 aa6.64□□□□□ -1.35
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USP40-216ENST00000485943 UBBP0CG47 229 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 DUX4L2P0CJ85 424 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 DUX4L3P0CJ86 424 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 DUX4L4P0CJ87 422 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 DUX4L5P0CJ88 424 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 DUX4L6P0CJ89 424 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 DUX4L7P0CJ90 424 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 COX7A1P24310 79 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 CALRP27797 417 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 NPBWR2P48146 333 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 ACSM1Q08AH1 577 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 FAM189A2Q15884 450 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 OR52W1Q6IF63 320 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 BRD3OSQ6XYD6 125 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 ZNF841Q6ZN19 808 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 KRT74Q7RTS7 529 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 CD177Q8N6Q3 437 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 OR51T1Q8NGJ9 327 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 NDNFQ8TB73 568 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 PHYHIPQ92561 330 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
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USP40-216ENST00000485943 UQCC2Q9BRT2 126 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 FKBP14Q9NWM8 211 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 OR6C3Q9NZP0 311 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 DUX4Q9UBX2 424 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 LRRC42Q9Y546 428 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 MAB21L2Q9Y586 359 aa6.64□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 MEIKINA0A087WXM9 373 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 H3BS24 57 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 MPIG6BO95866 241 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 LALBAP00709 142 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 IGHV1-69P01742 117 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 ARG1P05089 322 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 LPLP06858 475 aa6.63□□□□□ -1.35
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USP40-216ENST00000485943 ZNF728P0DKX0 622 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 CPEP16870 476 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 SRMP19623 302 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 NFYBP25208 207 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 GABRA5P31644 462 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 ECI1P42126 302 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 KCNJ3P48549 501 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 IL13RA2Q14627 380 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 ZNF146Q15072 292 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 NEDD8Q15843 81 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 RAB11BQ15907 218 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 MPV17LQ2QL34 196 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 CDH26Q8IXH8 852 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 SETD6Q8TBK2 473 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 FAM46BQ96A09 425 aa6.63□□□□□ -1.35
USP40-216ENST00000485943 ORAI1Q96D31 301 aa6.63□□□□□ -1.35
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