RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 GDPD3Q7L5L3 318 aa11.13□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 FGFRL1Q8N441 504 aa11.13□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 OR4M2Q8NGB6 313 aa11.13□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 OR6M1Q8NGM8 313 aa11.13□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 TBC1D15Q8TC07 691 aa11.13□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 YIPF6Q96EC8 236 aa11.13□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 CENPOQ9BU64 300 aa11.13□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 SELENOIQ9C0D9 397 aa11.13□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 CHST6Q9GZX3 395 aa11.13□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 CST11Q9H112 138 aa11.13□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 BANF2Q9H503 90 aa11.13□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 RNF167Q9H6Y7 350 aa11.13□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 ING3Q9NXR8 418 aa11.13□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 KAAG1Q9UBP8 84 aa11.13□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 ST3GAL6Q9Y274 331 aa11.13□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A1W2PP11 408 aa11.12□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 MPIG6BO95866 241 aa11.12□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 UBBP0CG47 229 aa11.12□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 AMY2BP19961 511 aa11.12□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 CLDN12P56749 244 aa11.12□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 EDDM3BP56851 147 aa11.12□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 GRK1Q15835 563 aa11.12□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 ATAD3CQ5T2N8 411 aa11.12□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM185AQ8N0U4 392 aa11.12□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 OR13F1Q8NGS4 319 aa11.12□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 PPP1R35Q8TAP8 253 aa11.12□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 NEK7Q8TDX7 302 aa11.12□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 SDSLQ96GA7 329 aa11.12□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 MRI1Q9BV20 369 aa11.12□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 FUNDC2Q9BWH2 189 aa11.12□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 ONECUT1Q9UBC0 465 aa11.12□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF222Q9UK12 451 aa11.12□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 MAB21L2Q9Y586 359 aa11.12□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC17A2O00624 439 aa11.11□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 ENSAO43768 121 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 NOL3O60936 208 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 OR2H2O95918 312 aa11.11□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 TK1P04183 234 aa11.11□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 ARSBP15848 533 aa11.11□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 MGMTP16455 207 aa11.11□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 HNF1AP20823 631 aa11.11□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 SDC2P34741 201 aa11.11□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 RANBP1P43487 201 aa11.11□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 RBM11P57052 281 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP1-1Q07627 177 aa11.11□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF146Q15072 292 aa11.11□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 C1orf100Q5SVJ3 147 aa11.11□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 GPR107Q5VW38 600 aa11.11□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 ELP2Q6IA86 826 aa11.11□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 ASCL4Q6XD76 172 aa11.11□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF841Q6ZN19 808 aa11.11□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 OR4M1Q8NGD0 313 aa11.11□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 C1orf159Q96HA4 380 aa11.11□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 GFI1Q99684 422 aa11.11□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 PPA2Q9H2U2 334 aa11.11□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 KCNK15Q9H427 330 aa11.11□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 C7orf69Q9H7B7 122 aa11.11□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 MMP26Q9NRE1 261 aa11.11□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 IL36GQ9NZH8 169 aa11.11□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 GHRLQ9UBU3 117 aa11.11□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 COL6A5A8TX70 2615 aa11.11□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa11.1□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 SHISA3A0PJX4 238 aa11.1□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 A8MXK9 166 aa11.1□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 C22orf46C9J442 243 aa11.1□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC22A1O15245 554 aa11.1□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 BPNT1O95861 308 aa11.1□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 ECDO95905 644 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 CAV3P56539 151 aa11.1□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 IL13RA2Q14627 380 aa11.1□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 TAF9Q16594 264 aa11.1□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 CR1LQ2VPA4 569 aa11.1□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 OR10K2Q6IF99 312 aa11.1□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa11.1□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 TPRA1Q86W33 373 aa11.1□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 CHST4Q8NCG5 386 aa11.1□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM104Q8NE00 496 aa11.1□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 OR51T1Q8NGJ9 327 aa11.1□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 RAB40AQ8WXH6 277 aa11.1□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM59Q9BXS4 323 aa11.1□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 STEAP1Q9UHE8 339 aa11.1□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 DAPK2Q9UIK4 370 aa11.1□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 ABCA1O95477 2261 aa11.1□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa11.09□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM82A0PJX8 343 aa11.09□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 IFITM5A6NNB3 132 aa11.09□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 K7N7A8 449 aa11.09□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 CLEC2LP0C7M8 214 aa11.09□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 PPIAL4GP0DN37 164 aa11.09□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 GATA3P23771 443 aa11.09□□□□□ -0.63
PGGT1B-204ENST00000503638 TGFBR1P36897 503 aa11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms