RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 DAP3P51398 398 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 DLX5P56178 289 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 FBXW4P57775 412 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 OR10A3P58181 314 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 RAP1BP61224 184 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 LCN6P62502 163 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 RAP1AP62834 184 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 PUDPQ08623 228 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 ZP4Q12836 540 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 MADCAM1Q13477 382 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC17A1Q14916 467 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 HAGHQ16775 308 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 Q499Y3 187 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 UBE2NLQ5JXB2 153 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF684Q5T5D7 378 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM27D1Q5T7N8 215 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM205Q6UW68 189 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRN1Q6UXK5 716 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 NR2C2APQ86WQ0 139 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC38A6Q8IZM9 456 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 RDH10Q8IZV5 341 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 APCDD1LQ8NCL9 501 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 OR4M2Q8NGB6 313 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 OR4M1Q8NGD0 313 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 OR4D10Q8NGI6 311 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 OR5D13Q8NGL4 314 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 OR5AK2Q8NH90 309 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 MFSD8Q8NHS3 518 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 OTOSQ8NHW6 89 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF519Q8TB69 540 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 NANPQ8TBE9 248 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNRF4Q8WWF5 429 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 ASB17Q8WXJ9 295 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 PIGCQ92535 297 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 HGDQ93099 445 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 COQ2Q96H96 371 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 OR8B4Q96RC9 309 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 WACQ9BTA9 647 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 PKIBQ9C010 78 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 SYT4Q9H2B2 425 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 WDR54Q9H977 334 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 CRLF2Q9HC73 371 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 TAS2R5Q9NYW4 299 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 GHRLQ9UBU3 117 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 SPATA2Q9UM82 520 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 NPIPA1Q9UND3 350 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 GON4LQ3T8J9 2241 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 ASXL3Q9C0F0 2248 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 WDFY4Q6ZS81 3184 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 PRSS37A4D1T9 235 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 ACOD1A6NK06 481 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 IFITM5A6NNB3 132 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 C17orf51A8MQB3 221 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 FTCDNL1E5RQL4 147 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 AIPO00170 330 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 DCTN6O00399 190 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 PLPP3O14495 311 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 TP53I11O14683 189 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 PLA2G10O15496 165 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 ORC5O43913 435 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC16A7O60669 478 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 UPK3AO75631 287 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 ECDO95905 644 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 PAHP00439 452 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 PAX1P15863 534 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 ATF1P18846 271 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 SRMP19623 302 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 ALOX5APP20292 161 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 HLA-DMAP28067 261 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 ID1P41134 155 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 RIDAP52758 137 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 RAB25P57735 213 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 GLO1Q04760 184 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 CD300CQ08708 224 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 SIGLEC14Q08ET2 396 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 FOXF1Q12946 379 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 SELENBP1Q13228 472 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-210ENST00000590211 OR7A5Q15622 319 aa3.49□□□□□ -1.85
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