RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-229ENST00000551936 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 RFKQ969G6 155 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 SLAMF9Q96A28 289 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 C10orf35Q96D05 121 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 BORCS8Q96FH0 119 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 SIGLEC9Q9Y336 463 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 J3QRE1 110 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 TSPAN15O95858 294 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 SERPINA3P01011 423 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 GABRA5P31644 462 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 EFNB2P52799 333 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 LGALS4P56470 323 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 SLC25A26Q70HW3 274 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 EGFL6Q8IUX8 553 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 SNX22Q96L94 193 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 GNG8Q9UK08 70 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 TMEM82A0PJX8 343 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 ODF3BA8MYP8 253 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 ENTPD6O75354 484 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 CIB2O75838 187 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 ALPLP05186 524 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 ZNF728P0DKX0 622 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 NPBWR2P48146 333 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 ATP1B3P54709 279 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 EDDM3BP56851 147 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 SLC25A30Q5SVS4 291 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 TMEM244Q5VVB8 128 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 TCF23Q7RTU1 214 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 FAM220AQ7Z4H9 259 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 OR8H2Q8N162 312 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 DNAAF1Q8NEP3 725 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 OR13D1Q8NGV5 346 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 OR2G2Q8NGZ5 317 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 PYDC1Q8WXC3 89 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 PP6455Q8WZ26 134 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 HRASLS5Q96KN8 279 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 RAB18Q9NP72 206 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 FRRS1LQ9P0K9 344 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 IL36RNQ9UBH0 155 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 WNK1Q9H4A3 2382 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 VGLL3A8MV65 326 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 RBP4P02753 201 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 ARG1P05089 322 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 ISG15P05161 165 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 IGHV1-8P0DP01 117 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 ATF1P18846 271 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 RBP2P50120 134 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 OR12D2P58182 307 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 ZNF91Q05481 1191 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 HERPUD1Q15011 391 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 FDX2Q6P4F2 183 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 LIAT1Q6ZQX7 453 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 GDPD3Q7L5L3 318 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 OR11H6Q8NGC7 330 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 OR52N4Q8NGI2 321 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 FGGYQ96C11 551 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 MALSU1Q96EH3 234 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 RNFT2Q96EX2 444 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 FOXJ3Q9UPW0 622 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
CS-229ENST00000551936 DAPL1A0PJW8 107 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-229ENST00000551936 H3BNX3 289 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-229ENST00000551936 CHST1O43916 411 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-229ENST00000551936 PSPNO60542 156 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-229ENST00000551936 HAND1O96004 215 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-229ENST00000551936 IGHA1P01876 353 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-229ENST00000551936 BCL3P20749 454 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-229ENST00000551936 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
CS-229ENST00000551936 PEX2P28328 305 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-229ENST00000551936 RAB13P51153 203 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-229ENST00000551936 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
CS-229ENST00000551936 ACTC1P68032 377 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-229ENST00000551936 ACTA1P68133 377 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-229ENST00000551936 ZNF146Q15072 292 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-229ENST00000551936 C2orf68Q2NKX9 166 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-229ENST00000551936 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
CS-229ENST00000551936 MEDAGQ5VYS4 303 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-229ENST00000551936 ZNF626Q68DY1 528 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-229ENST00000551936 C11orf88Q6PI97 169 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-229ENST00000551936 UTS2BQ765I0 119 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-229ENST00000551936 Q8IYB0 196 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-229ENST00000551936 ENTHD1Q8IYW4 607 aa11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms