RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494570.1

KDM4C-211, Transcript of lysine demethylase 4C, humanhuman

TSL 2

Gene KDM4C, Length 647 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4C-211ENST00000494570 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa6.76□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 RASL12Q9NYN1 266 aa6.76□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 IL36RNQ9UBH0 155 aa6.76□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 DNAJB11Q9UBS4 358 aa6.76□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 HHLA2Q9UM44 414 aa6.76□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 A0A0A6YYJ9 748 aa6.75□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.75□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 TMEM212A6NML5 194 aa6.75□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 H0YJX3 145 aa6.75□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 GATBO75879 557 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 ECDO95905 644 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 LIPFP07098 398 aa6.75□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 PIPP12273 146 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 PRDX2P32119 198 aa6.75□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 NPBWR2P48146 333 aa6.75□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 DLX1P56177 255 aa6.75□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 CAV3P56539 151 aa6.75□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 ARF6P62330 175 aa6.75□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 IL13RA1P78552 427 aa6.75□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 ST3GAL4Q11206 333 aa6.75□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 CDK5R1Q15078 307 aa6.75□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 SLC25A26Q70HW3 274 aa6.75□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa6.75□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 C11orf42Q8N5U0 333 aa6.75□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 PARP16Q8N5Y8 322 aa6.75□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 TEX29Q8N6K0 151 aa6.75□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 ZNF676Q8N7Q3 588 aa6.75□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa6.75□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 SETD9Q8NE22 299 aa6.75□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.75□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 GATAD2BQ8WXI9 593 aa6.75□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 TNFRSF14Q92956 283 aa6.75□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 TMEM80Q96HE8 168 aa6.75□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 MED30Q96HR3 178 aa6.75□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 WDFY2Q96P53 400 aa6.75□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 C19orf24Q9BVV8 132 aa6.75□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 PRDM13Q9H4Q3 707 aa6.75□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 CNTD2Q9H8S5 307 aa6.75□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 BABAM2Q9NXR7 383 aa6.75□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 SLC7A11Q9UPY5 501 aa6.75□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 TRAV40A0A0B4J280 105 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 TMEM82A0PJX8 343 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 EREGO14944 169 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 NDUFB3O43676 98 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 ZNF737O75373 536 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 NXPH2O95156 264 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 SERPINA3P01011 423 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 KNG1P01042 644 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 GABRA2P47869 451 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 RBP2P50120 134 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 ZP1P60852 638 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 PDZK1IP1Q13113 114 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 CCDC58Q4VC31 144 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 LRRC10Q5BKY1 277 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 ARMCX4Q5H9R4 360 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 HCP5Q6MZN7 132 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 BRD3OSQ6XYD6 125 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 OR51A2Q8NGJ7 313 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 OR13C3Q8NGS6 347 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 OR13C5Q8NGS8 318 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 OR13C9Q8NGT0 318 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 OR52N1Q8NH53 320 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 OR5AK2Q8NH90 309 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 SLAMF9Q96A28 289 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 SPSB1Q96BD6 273 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 BORCS8Q96FH0 119 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 PGLYRP3Q96LB9 341 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 CEP19Q96LK0 163 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 SPACA5Q96QH8 159 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 PCGF1Q9BSM1 259 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 PLEKHA1Q9HB21 404 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 KPTNQ9Y664 436 aa6.74□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa6.73□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 IRGMA1A4Y4 181 aa6.73□□□□□ -1.33
KDM4C-211ENST00000494570 EFCAB10A6NFE3 127 aa6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms