RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 OR8J1Q8NGP2 316 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 OR2T27Q8NH04 317 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF671Q8TAW3 534 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 ST8SIA4Q92187 359 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 RFKQ969G6 155 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 SEH1LQ96EE3 360 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 DUX5Q96PT3 197 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 GABARAPL3Q9BY60 117 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 SNTG1Q9NSN8 517 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 HAO2Q9NYQ3 351 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 CTSZQ9UBR2 303 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 DAPK2Q9UIK4 370 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 OR52A1Q9UKL2 312 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 PIGLQ9Y2B2 252 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 SNX5Q9Y5X3 404 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 R4GMQ9 66 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 TRAV40A0A0B4J280 105 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 PRR32B1ATL7 298 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF879B4DU55 563 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 C22orf46C9J442 243 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 P2RY10O00398 339 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 RGS13O14921 159 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 TOX4O94842 621 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 GABARAPO95166 117 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 ECDO95905 644 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 NRASP01111 189 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 FSHBP01225 129 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 TTRP02766 147 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 ALPLP05186 524 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC159P0C7I6 412 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 PPIAL4GP0DN37 164 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 FAHP16930 419 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 GLRA1P23415 457 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 CD40LGP29965 261 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 GABRA2P47869 451 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 SERPINB10P48595 397 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 ARF6P62330 175 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 GNG3P63215 75 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 PAX2Q02962 417 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 BAMBIQ13145 260 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 IKZF1Q13422 519 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 NEDD8Q15843 81 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 CTF1Q16619 201 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 DGUOKQ16854 277 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 ODF4Q2M2E3 257 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 CEACAM21Q3KPI0 293 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 LRRC10Q5BKY1 277 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 WDR38Q5JTN6 314 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF684Q5T5D7 378 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 GPR157Q5UAW9 335 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 METTL11BQ5VVY1 283 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 BTN2A1Q7KYR7 527 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 FAM220AQ7Z4H9 259 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 ELMOD2Q8IZ81 293 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 MFSD4AQ8N468 514 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 OR5A2Q8NGI9 324 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 FAM216AQ8WUB2 273 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 UPRTQ96BW1 309 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 FUNDC2Q9BWH2 189 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 TLNRD1Q9H1K6 362 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 CNTD2Q9H8S5 307 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 MOB1AQ9H8S9 216 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 SMURF1Q9HCE7 757 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 FAM118AQ9NWS6 357 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 SLC22A13Q9Y226 551 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 A3GALT2U3KPV4 340 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1B0GVI7 797 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 A6NIN4 97 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 NKX6-3A6NJ46 265 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 METTL15A6NJ78 407 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 OR5B21A6NL26 309 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 SNTNA6NMZ2 147 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 SRRM5B3KS81 715 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 H3BSH0 61 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 SLC16A6O15403 523 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 RHBDL1O75783 438 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 DHRS3O75911 302 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 SFTPBP07988 381 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 CFHR2P36980 270 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 PPP5CP53041 499 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 SPCS2Q15005 226 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 FAM76BQ5HYJ3 339 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 ZBTB37Q5TC79 503 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 BRD3OSQ6XYD6 125 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 DOK3Q7L591 496 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRM-214ENST00000583153 SSX6Q7RTT6 188 aa6.9□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms