RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516230.1

RNU6-287P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 287, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-287P, Length 98 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-287P-201ENST00000516230 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 HES2Q9Y543 173 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 USH1CQ9Y6N9 552 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 ELP1O95163 1332 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLX4Q8IY92 1834 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 A0A0G2JMP0 313 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 A0A0X1KG70 313 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 TMEM72A0PK05 275 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 XKRY2A2RUG3 117 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 A6NED7 52 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZW10O43264 779 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 NMT2O60551 498 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 CTNSO60931 367 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 CRPP02741 224 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 TNNI3P19429 210 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 IL32P24001 234 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 TEAD1P28347 426 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 CD70P32970 193 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 GRIA1P42261 906 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 SSR4P51571 173 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 RAP1GDS1P52306 607 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 NUCB1Q02818 461 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 SELPLGQ14242 412 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF266Q14584 549 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF726P1Q15940 193 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 PSG3Q16557 428 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 C1orf185Q5T7R7 199 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 UBE2UQ5VVX9 321 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 NIPAL1Q6NVV3 410 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 ITPRIPQ8IWB1 547 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR8H2Q8N162 312 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 C1orf158Q8N1D5 194 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 DYNAPQ8N1N2 210 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 Q8N2B8 174 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 ARL10Q8N8L6 244 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 PRELID2Q8N945 189 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZDHHC22Q8N966 263 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 C15orf53Q8NAA6 179 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR11H6Q8NGC7 330 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR8A1Q8NGG7 326 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR6K6Q8NGW6 343 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR8S1Q8NH09 359 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR4A5Q8NH83 315 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAM57AQ8TBR7 257 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 PIBF1Q8WXW3 757 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 THRSPQ92748 146 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 CMTM5Q96DZ9 223 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 PYURFQ96I23 114 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 PKNOX2Q96KN3 472 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 SAMD8Q96LT4 415 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 COPS8Q99627 209 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 PRRT1Q99946 306 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 C20orf144Q9BQM9 153 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 REG4Q9BYZ8 158 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 LRRN3Q9H3W5 708 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 CWH43Q9H720 699 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 GRPEL1Q9HAV7 217 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 ELOVL3Q9HB03 270 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 DCAF16Q9NXF7 216 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 SNURFQ9Y675 71 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 CNTNAP1P78357 1384 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 NCAPD2Q15021 1401 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 DNAH10Q8IVF4 4471 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 NUP205Q92621 2012 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 SYCE3A1L190 88 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 CDC7O00311 574 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 ISLRO14498 428 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 PPP1R2P9O14990 202 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 RAD1O60671 282 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 POP7O75817 140 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 GOSR1O95249 250 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 C1orf105O95561 183 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 CLIC3O95833 236 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 CDK1P06493 297 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 CCDC192P0DO97 292 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 HTR2AP28223 471 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 SFNP31947 248 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 BMI1P35226 326 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 NDUFA8P51970 172 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 CDH6P55285 790 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-287P-201ENST00000516230 TOMM20Q15388 145 aa-0.76□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms