RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 CALCBP10092 127 aa25.13■■□□□ 1.61
ECHS1-201ENST00000368547 CD40LGP29965 261 aa25.13■■□□□ 1.61
ECHS1-201ENST00000368547 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa25.13■■□□□ 1.61
ECHS1-201ENST00000368547 OR1M1Q8NGA1 313 aa25.13■■□□□ 1.61
ECHS1-201ENST00000368547 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
ECHS1-201ENST00000368547 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
ECHS1-201ENST00000368547 PALMDQ9NP74 551 aa25.13■■□□□ 1.61
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM138Q9NPI0 162 aa25.13■■□□□ 1.61
ECHS1-201ENST00000368547 SPATA2Q9UM82 520 aa25.13■■□□□ 1.61
ECHS1-201ENST00000368547 APCP25054 2843 aa25.13■■□□□ 1.61
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ECHS1-201ENST00000368547 CDKN1AP38936 164 aa25.12■■□□□ 1.61
ECHS1-201ENST00000368547 MOB3CQ70IA8 216 aa25.12■■□□□ 1.61
ECHS1-201ENST00000368547 CDH26Q8IXH8 852 aa25.12■■□□□ 1.61
ECHS1-201ENST00000368547 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
ECHS1-201ENST00000368547 ELMOD3Q96FG2 381 aa25.12■■□□□ 1.61
ECHS1-201ENST00000368547 BDKRB2P30411 391 aa25.12■■□□□ 1.61
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ECHS1-201ENST00000368547 UBE2V2Q15819 145 aa25.12■■□□□ 1.61
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ECHS1-201ENST00000368547 UTS2BQ765I0 119 aa25.12■■□□□ 1.61
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ECHS1-201ENST00000368547 ITPKCQ96DU7 683 aa25.12■■□□□ 1.61
ECHS1-201ENST00000368547 STEAP1Q9UHE8 339 aa25.12■■□□□ 1.61
ECHS1-201ENST00000368547 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
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ECHS1-201ENST00000368547 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
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ECHS1-201ENST00000368547 OR51A2Q8NGJ7 313 aa25.11■■□□□ 1.61
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ECHS1-201ENST00000368547 HES5Q5TA89 166 aa25.1■■□□□ 1.61
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ECHS1-201ENST00000368547 OR13C9Q8NGT0 318 aa25.1■■□□□ 1.61
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ECHS1-201ENST00000368547 ETV7Q9Y603 341 aa25.1■■□□□ 1.61
ECHS1-201ENST00000368547 H7C417 338 aa25.09■■□□□ 1.61
ECHS1-201ENST00000368547 ALDOBP05062 364 aa25.09■■□□□ 1.61
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ECHS1-201ENST00000368547 CEACAM21Q3KPI0 293 aa25.09■■□□□ 1.61
ECHS1-201ENST00000368547 DIRAS2Q96HU8 199 aa25.09■■□□□ 1.61
ECHS1-201ENST00000368547 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa25.09■■□□□ 1.61
ECHS1-201ENST00000368547 LIN7BQ9HAP6 207 aa25.09■■□□□ 1.61
ECHS1-201ENST00000368547 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
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ECHS1-201ENST00000368547 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
ECHS1-201ENST00000368547 C1orf100Q5SVJ3 147 aa25.08■■□□□ 1.61
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ECHS1-201ENST00000368547 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa25.08■■□□□ 1.61
ECHS1-201ENST00000368547 V9GYH0 126 aa25.08■■□□□ 1.61
ECHS1-201ENST00000368547 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa25.08■■□□□ 1.6
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ECHS1-201ENST00000368547 APOA1P02647 267 aa25.08■■□□□ 1.6
ECHS1-201ENST00000368547 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
ECHS1-201ENST00000368547 TNFSF4P23510 183 aa25.08■■□□□ 1.6
ECHS1-201ENST00000368547 CAPZA1P52907 286 aa25.08■■□□□ 1.6
ECHS1-201ENST00000368547 PCGF3Q3KNV8 242 aa25.08■■□□□ 1.6
ECHS1-201ENST00000368547 SAMD12Q8N8I0 201 aa25.08■■□□□ 1.6
ECHS1-201ENST00000368547 SPERTQ8NA61 448 aa25.08■■□□□ 1.6
ECHS1-201ENST00000368547 OR6M1Q8NGM8 313 aa25.08■■□□□ 1.6
ECHS1-201ENST00000368547 SORCS2Q96PQ0 1159 aa25.08■■□□□ 1.6
ECHS1-201ENST00000368547 RAB1BQ9H0U4 201 aa25.08■■□□□ 1.6
ECHS1-201ENST00000368547 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
ECHS1-201ENST00000368547 SPG11Q96JI7 2443 aa25.07■■□□□ 1.6
ECHS1-201ENST00000368547 MAB21L1Q13394 359 aa25.07■■□□□ 1.6
ECHS1-201ENST00000368547 RAB11BQ15907 218 aa25.07■■□□□ 1.6
ECHS1-201ENST00000368547 SPRNQ5BIV9 151 aa25.07■■□□□ 1.6
ECHS1-201ENST00000368547 FAM209AQ5JX71 171 aa25.07■■□□□ 1.6
ECHS1-201ENST00000368547 LGALS14Q8TCE9 139 aa25.07■■□□□ 1.6
ECHS1-201ENST00000368547 RNF170Q96K19 258 aa25.07■■□□□ 1.6
ECHS1-201ENST00000368547 TECTBQ96PL2 329 aa25.07■■□□□ 1.6
ECHS1-201ENST00000368547 OR2V2Q96R30 315 aa25.07■■□□□ 1.6
ECHS1-201ENST00000368547 MICU1Q9BPX6 476 aa25.07■■□□□ 1.6
ECHS1-201ENST00000368547 SOSTQ9BQB4 213 aa25.07■■□□□ 1.6
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ECHS1-201ENST00000368547 CXXC4Q9H2H0 198 aa25.07■■□□□ 1.6
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ECHS1-201ENST00000368547 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa25.06■■□□□ 1.6
ECHS1-201ENST00000368547 J3QRK9 145 aa25.06■■□□□ 1.6
ECHS1-201ENST00000368547 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
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ECHS1-201ENST00000368547 GPM6AP51674 278 aa25.06■■□□□ 1.6
ECHS1-201ENST00000368547 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
ECHS1-201ENST00000368547 OR5A2Q8NGI9 324 aa25.06■■□□□ 1.6
ECHS1-201ENST00000368547 DECR2Q9NUI1 292 aa25.06■■□□□ 1.6
ECHS1-201ENST00000368547 IL19Q9UHD0 177 aa25.06■■□□□ 1.6
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