RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	FAM209A	Q5JX71	171 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF787	Q6DD87	383 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658		Q6ZR03	302 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	USP43	Q70EL4	1123 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	TPRA1	Q86W33	373 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	ISOC1	Q96CN7	298 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	S100A13	Q99584	98 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	CACNA1D	Q01668	2161 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658		F5H5P2	479 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	PIN1P1	O15428	100 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	MLNR	O43193	412 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	ALX3	O95076	343 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	CDRT1	O95170	752 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	IGHV1-46	P01743	117 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	SOD3	P08294	240 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	DANCR	P0C864	163 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	POU3F4	P49335	361 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	MTCP1	P56278	107 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	NCS1	P62166	190 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	MXD1	Q05195	221 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	TESK1	Q15569	626 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	MST1L	Q2TV78	715 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	KRT74	Q7RTS7	529 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF573	Q86YE8	665 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	ITPKC	Q96DU7	683 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	OR2V2	Q96R30	315 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	IL19	Q9UHD0	177 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	LRP5L	A4QPB2	252 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	DPPA5	A6NC42	116 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	ALDOB	P05062	364 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	GRP	P07492	148 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	ADH4	P08319	380 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	PRF1	P14222	555 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	IRF2	P14316	349 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	SDC2	P34741	201 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	CD200	P41217	278 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	HAAO	P46952	286 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	CCL8	P80075	99 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	RFT1	Q96AA3	541 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	SPACA5	Q96QH8	159 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658		V9GY05	133 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658		H7C417	338 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	PLAT	P00750	562 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	IL1A	P01583	271 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	CD55	P08174	381 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	THBS2	P35442	1172 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	SOX6	P35712	828 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	TGFBR1	P36897	503 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	CDKN1A	P38936	164 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	KISS1	Q15726	138 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	CTF1	Q16619	201 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF529	Q6P280	563 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	CDH26	Q8IXH8	852 aa		10.1	□□□□□ -0.79

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