RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533012.1

TRAPPC4-211, Transcript of trafficking protein particle complex 4, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC4, Length 817 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4-211ENST00000533012 IRF2P14316 349 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC4-211ENST00000533012 GATA4P43694 442 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC4-211ENST00000533012 SERPINB10P48595 397 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC4-211ENST00000533012 GNG3P63215 75 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC4-211ENST00000533012 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC4-211ENST00000533012 GPR107Q5VW38 600 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZNF367Q7RTV3 350 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC4-211ENST00000533012 MOGAT3Q86VF5 341 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC4-211ENST00000533012 MS4A15Q8N5U1 240 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC4-211ENST00000533012 OR5D14Q8NGL3 314 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC4-211ENST00000533012 OR11L1Q8NGX0 322 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC4-211ENST00000533012 YIPF5Q969M3 257 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC4-211ENST00000533012 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC4-211ENST00000533012 PGLYRP3Q96LB9 341 aa9.51□□□□□ -0.89
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TRAPPC4-211ENST00000533012 CHST5Q9GZS9 411 aa9.51□□□□□ -0.89
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TRAPPC4-211ENST00000533012 NEK6Q9HC98 313 aa9.51□□□□□ -0.89
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TRAPPC4-211ENST00000533012 SLC22A1O15245 554 aa9.5□□□□□ -0.89
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TRAPPC4-211ENST00000533012 DMRTC1Q5HYR2 192 aa9.5□□□□□ -0.89
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TRAPPC4-211ENST00000533012 OR1M1Q8NGA1 313 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC4-211ENST00000533012 C10orf105Q8TEF2 133 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC4-211ENST00000533012 HPS1Q92902 700 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC4-211ENST00000533012 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC4-211ENST00000533012 TIMD4Q96H15 378 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC4-211ENST00000533012 Q96MF0 132 aa9.5□□□□□ -0.89
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TRAPPC4-211ENST00000533012 SLC25A16P16260 332 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC4-211ENST00000533012 CPEP16870 476 aa9.49□□□□□ -0.89
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TRAPPC4-211ENST00000533012 GIFP27352 417 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC4-211ENST00000533012 THBS2P35442 1172 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC4-211ENST00000533012 PMELP40967 661 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC4-211ENST00000533012 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC4-211ENST00000533012 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
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TRAPPC4-211ENST00000533012 TRAM1Q15629 374 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZNF181Q2M3W8 571 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC4-211ENST00000533012 Q499Y3 187 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC4-211ENST00000533012 ARMCX4Q5H9R4 360 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC4-211ENST00000533012 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC4-211ENST00000533012 UBE2UQ5VVX9 321 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZNF573Q86YE8 665 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC4-211ENST00000533012 C1orf87Q8N0U7 546 aa9.49□□□□□ -0.89
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TRAPPC4-211ENST00000533012 Q8TCH9 128 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC4-211ENST00000533012 HPSE2Q8WWQ2 592 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC4-211ENST00000533012 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC4-211ENST00000533012 THRSPQ92748 146 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC4-211ENST00000533012 RAB1CQ92928 201 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC4-211ENST00000533012 TMEM106AQ96A25 262 aa9.49□□□□□ -0.89
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TRAPPC4-211ENST00000533012 TMED9Q9BVK6 235 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC4-211ENST00000533012 C1orf123Q9NWV4 160 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC4-211ENST00000533012 USF3Q68DE3 2245 aa9.48□□□□□ -0.89
TRAPPC4-211ENST00000533012 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
TRAPPC4-211ENST00000533012 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa9.48□□□□□ -0.89
TRAPPC4-211ENST00000533012 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa9.48□□□□□ -0.89
TRAPPC4-211ENST00000533012 LRP5LA4QPB2 252 aa9.48□□□□□ -0.89
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