RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602190.1

IRF3-231, Transcript of interferon regulatory factor 3, human

TSL 3

Gene IRF3, Length 413 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IRF3-231	ENST00000602190	TVP23A	A6NH52	213 aa		14.79	□□□□□ -0.04
IRF3-231	ENST00000602190	TMEM210	A6NLX4	147 aa		14.79	□□□□□ -0.04
IRF3-231	ENST00000602190	SLC7A2	P52569	658 aa		14.79	□□□□□ -0.04
IRF3-231	ENST00000602190	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		14.79	□□□□□ -0.04
IRF3-231	ENST00000602190	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	14.79	□□□□□ -0.04
IRF3-231	ENST00000602190	LNX2	Q8N448	690 aa		14.79	□□□□□ -0.04
IRF3-231	ENST00000602190	OR2T4	Q8NH00	348 aa		14.79	□□□□□ -0.04
IRF3-231	ENST00000602190	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		14.79	□□□□□ -0.04
IRF3-231	ENST00000602190	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
IRF3-231	ENST00000602190	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		14.79	□□□□□ -0.04
IRF3-231	ENST00000602190	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		14.79	□□□□□ -0.04
IRF3-231	ENST00000602190	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		14.79	□□□□□ -0.04
IRF3-231	ENST00000602190	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
IRF3-231	ENST00000602190	LRP12	Q9Y561	859 aa		14.79	□□□□□ -0.04
IRF3-231	ENST00000602190	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		14.78	□□□□□ -0.04
IRF3-231	ENST00000602190	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		14.78	□□□□□ -0.04
IRF3-231	ENST00000602190	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	14.78	□□□□□ -0.04
IRF3-231	ENST00000602190	DIRAS1	O95057	198 aa		14.78	□□□□□ -0.04
IRF3-231	ENST00000602190	TFF1	P04155	84 aa		14.78	□□□□□ -0.04
IRF3-231	ENST00000602190	VSIG8	P0DPA2	414 aa		14.78	□□□□□ -0.04
IRF3-231	ENST00000602190	PAX6	P26367	422 aa		14.78	□□□□□ -0.04
IRF3-231	ENST00000602190	GSK3A	P49840	483 aa		14.78	□□□□□ -0.04
IRF3-231	ENST00000602190	ENTPD1	P49961	510 aa		14.78	□□□□□ -0.04
IRF3-231	ENST00000602190	IL5RA	Q01344	420 aa		14.78	□□□□□ -0.04
IRF3-231	ENST00000602190	BLMH	Q13867	455 aa		14.78	□□□□□ -0.04
IRF3-231	ENST00000602190	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	14.78	□□□□□ -0.04
IRF3-231	ENST00000602190	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		14.78	□□□□□ -0.04
IRF3-231	ENST00000602190	OR52J3	Q8NH60	311 aa		14.78	□□□□□ -0.04
IRF3-231	ENST00000602190	REEP6	Q96HR9	211 aa		14.78	□□□□□ -0.04
IRF3-231	ENST00000602190	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	14.78	□□□□□ -0.04
IRF3-231	ENST00000602190	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		14.78	□□□□□ -0.04
IRF3-231	ENST00000602190	TCF19	Q9Y242	345 aa		14.78	□□□□□ -0.04
IRF3-231	ENST00000602190	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		14.78	□□□□□ -0.04
IRF3-231	ENST00000602190	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		14.78	□□□□□ -0.04
IRF3-231	ENST00000602190	NCK1	P16333	377 aa		14.77	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	14.77	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	BMX	P51813	675 aa		14.77	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	14.77	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	CD83	Q01151	205 aa		14.77	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	TSPAN31	Q12999	210 aa		14.77	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		14.77	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		14.77	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	14.77	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		14.77	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		14.77	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	SDSL	Q96GA7	329 aa		14.77	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	14.77	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	NLK	Q9UBE8	527 aa		14.77	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190		A0A1W2PQ09	198 aa		14.76	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	DHRS12	A0PJE2	317 aa		14.76	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190		A6NDX4	124 aa		14.76	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	OR2AT4	A6NND4	320 aa		14.76	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	ANGPTL7	O43827	346 aa		14.76	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	MPIG6B	O95866	241 aa		14.76	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	CST4	P01036	141 aa		14.76	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	ACKR3	P25106	362 aa		14.76	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	CX3CR1	P49238	355 aa		14.76	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		14.76	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	SNCB	Q16143	134 aa		14.76	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		14.76	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		14.76	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	MKX	Q8IYA7	352 aa		14.76	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		14.76	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		14.76	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		14.76	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	FAM162A	Q96A26	154 aa		14.76	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	MICU1	Q9BPX6	476 aa		14.76	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		14.76	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	RGCC	Q9H4X1	137 aa		14.76	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	ABCB9	Q9NP78	766 aa		14.76	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	IL20	Q9NYY1	176 aa		14.76	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	GSTA4	O15217	222 aa		14.75	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	AKR7A2	O43488	359 aa		14.75	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	PSG2	P11465	335 aa		14.75	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	IGLL1	P15814	213 aa		14.75	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	NDUFB7	P17568	137 aa		14.75	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	SMIM11A	P58511	58 aa		14.75	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	TIGD6	Q17RP2	521 aa		14.75	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	ZNF511	Q8NB15	262 aa		14.75	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		14.75	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		14.75	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		14.75	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		14.75	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	CENPM	Q9NSP4	180 aa		14.75	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		14.75	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		14.74	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190		H0YAE9	185 aa		14.74	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	NDUFAB1	O14561	156 aa		14.74	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	GADD45G	O95257	159 aa		14.74	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	SPARC	P09486	303 aa		14.74	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	FAH	P16930	419 aa		14.74	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	SLC15A1	P46059	708 aa		14.74	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	DYNLT3	P51808	116 aa		14.74	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	SLC25A1	P53007	311 aa		14.74	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		14.74	□□□□□ -0.05

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