RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CDK5Q00535 292 aa15.47■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SSX1Q16384 188 aa15.47■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A0A1W2PPH5 198 aa15.47■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 POM121BA6NF01 834 aa15.47■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SEMG1P04279 462 aa15.47■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RANP62826 216 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ERGIC1Q969X5 290 aa15.47■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DOK1Q99704 481 aa15.47■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UCK1Q9HA47 277 aa15.47■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPP1P10451 314 aa15.46■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CD27P26842 260 aa15.46■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OSR2Q8N2R0 312 aa15.46■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MORN4Q8NDC4 146 aa15.46■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FGF14Q92915 247 aa15.46■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CXorf58Q96LI9 332 aa15.46■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa15.46■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A0A096LPE4 126 aa15.46■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A0A1W2PPZ6 126 aa15.46■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RPL11P62913 178 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PARD6AQ9NPB6 346 aa15.46■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MMP17Q9ULZ9 603 aa15.46■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CD300CQ08708 224 aa15.46■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa15.46■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 WNK3Q9BYP7 1800 aa15.46■□□□□ 0.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C2CD4DB7Z1M9 353 aa15.46■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GLRA1P23415 457 aa15.46■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ARR3P36575 388 aa15.46■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HAAOP46952 286 aa15.46■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LGALS4P56470 323 aa15.46■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GSG1Q2KHT4 349 aa15.46■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCL4L1Q8NHW4 92 aa15.46■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IDSB3KWA1 339 aa15.45■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SRFP11831 508 aa15.45■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KIAA1958Q8N8K9 716 aa15.45■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR10D4PQ8NGN7 298 aa15.45■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C11orf40Q8WZ69 217 aa15.45■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa15.45■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ADH4P08319 380 aa15.45■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM162BQ5T6X4 162 aa15.45■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa15.45■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KLHDC1Q8N7A1 406 aa15.45■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LRP12Q9Y561 859 aa15.45■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CLEC18AA5D8T8 446 aa15.45■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa15.45■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 H0YIG0 161 aa15.45■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 H3BP45 60 aa15.45■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CST7O76096 145 aa15.45■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LIMS3P0CW19 117 aa15.45■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LIMS4P0CW20 117 aa15.45■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KCNJ3P48549 501 aa15.45■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RTL8BQ17RB0 113 aa15.45■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC25A26Q70HW3 274 aa15.45■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CLEC18CQ8NCF0 446 aa15.45■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PCMT1P22061 227 aa15.45■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCL11P51671 97 aa15.45■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RAE1P78406 368 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HYAL1Q12794 435 aa15.45■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF628Q5EBL2 1059 aa15.45■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRR27Q6MZM9 219 aa15.45■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TAAR6Q96RI8 345 aa15.45■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FOXQ1Q9C009 403 aa15.45■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FPR2P25090 351 aa15.45■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ASCL1P50553 236 aa15.45■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ADGRL4Q9HBW9 690 aa15.45■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa15.44■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FRG2CA6NGY1 282 aa15.44■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FZD6O60353 706 aa15.44■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RAB13P51153 203 aa15.44■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C1orf53Q5VUE5 145 aa15.44■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ANKRD16Q6P6B7 361 aa15.44■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FBXL6Q8N531 539 aa15.44■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IL20Q9NYY1 176 aa15.44■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa15.44■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SERPINE3A8MV23 424 aa15.44■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CST4P01036 141 aa15.44■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 B4GALNT1Q00973 533 aa15.44■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ELFN2Q5R3F8 820 aa15.44■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZDHHC22Q8N966 263 aa15.44■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCDC74AQ96AQ1 378 aa15.44■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C8orf44Q96CB5 159 aa15.44■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRRX2Q99811 253 aa15.44■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TNFSF11O14788 317 aa15.44■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ONECUT2O95948 504 aa15.44■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PNPP00491 289 aa15.44■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF17P17021 662 aa15.44■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PAX6P26367 422 aa15.44■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HOXC8P31273 242 aa15.44■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OTOSQ8NHW6 89 aa15.44■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BOD1Q96IK1 185 aa15.44■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 VAMP8Q9BV40 100 aa15.44■□□□□ 0.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms