RNA–Protein interactions for RNA: YMR001C-A

YMR001C-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR001C-A, Length 231 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR001C-AYMR001C-A HOM2P13663 365 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A ORC2P32833 620 aa3.83□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A CAF16P43569 289 aa3.83□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A NOP9P47077 666 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A ARP4P80428 489 aa3.83□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A SNP1Q00916 300 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A REC102Q02721 264 aa3.83□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A HMO1Q03973 246 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A RPN7Q06103 429 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A OSW1Q08692 278 aa3.83□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A VPS34P22543 875 aa3.82□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A PEX1P24004 1043 aa3.82□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A TIM23P32897 222 aa3.82□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A GMH1P36125 273 aa3.82□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A PAC2P39937 518 aa3.82□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A STE12P13574 688 aa3.81□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A MEF1P25039 761 aa3.81□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A VBA3P25594 458 aa3.81□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A TMT1P32643 299 aa3.81□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A BCS1P32839 456 aa3.81□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A MUP3P38734 546 aa3.81□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A YHR097CP38809 366 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A DSS1P39112 969 aa3.81□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A GLO1P50107 326 aa3.81□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A YGR151CP53287 111 aa3.81□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A RIM13Q03792 727 aa3.81□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A NHX1Q04121 633 aa3.81□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A YOR131CQ12486 218 aa3.81□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A MDM12Q92328 271 aa3.81□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A YKR018CP36114 725 aa3.8□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A HSL7P38274 827 aa3.8□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A KSP1P38691 1029 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A GID8P40208 455 aa3.8□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A PCL10P53124 433 aa3.8□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A SPC98P53540 846 aa3.8□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A THI22Q06490 572 aa3.8□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A ERG11P10614 530 aa3.79□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A RPA135P22138 1203 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A RSC8P43609 557 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A NMA2P53204 395 aa3.79□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A KCC4P25389 1037 aa3.78□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A HOG1P32485 435 aa3.78□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A SRP40P32583 406 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A YMC2P38087 329 aa3.78□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A MIT1P40002 666 aa3.78□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A NNF1P47149 201 aa3.78□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A MRK1P50873 501 aa3.78□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A FMP30Q02883 468 aa3.78□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A YDL086WQ07505 273 aa3.78□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A CLF1Q12309 687 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A YOL098CQ12496 1037 aa3.78□□□□□ -1.8
YMR001C-AYMR001C-A SRD1P09007 221 aa3.77□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A RAD18P10862 487 aa3.77□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A MNN4P36044 1178 aa3.77□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data3.77□□□□□ -1.81not detected
YMR001C-AYMR001C-A BIT2P38346 545 aa3.77□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A AIM14P53109 570 aa3.77□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A BRE5P53741 515 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A DIA2Q08496 732 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A SLK19Q08581 821 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A LAM4P38800 1345 aa3.76□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A PHO5P00635 467 aa3.76□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A GSY1P23337 708 aa3.76□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A FEN2P25621 512 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A YMC1P32331 307 aa3.76□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A YKL091CP33324 310 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A APN2P38207 520 aa3.76□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A PMC1P38929 1173 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A PIG2P40187 538 aa3.76□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A SET2P46995 733 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A MPS3P47069 682 aa3.76□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A RFX1P48743 811 aa3.76□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A SEC5P89102 971 aa3.76□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A SEG1Q04279 960 aa3.76□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A CHS5Q12114 671 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A NUP1P20676 1076 aa3.75□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A SAT4P25333 603 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A SEC6P32844 805 aa3.75□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A NUP82P40368 713 aa3.75□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A GAT1P43574 510 aa3.75□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A ASN1P49089 572 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A CIT2P08679 460 aa3.74□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A PRP28P23394 588 aa3.74□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A DOT6P40059 670 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A KHA1P40309 873 aa3.74□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A XBP1P40489 647 aa3.74□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A YIL077CP40508 320 aa3.74□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A BUD6P41697 788 aa3.74□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A RPN4Q03465 531 aa3.74□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A VPS36Q06696 566 aa3.74□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A ADE5,7P07244 802 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A HMG1P12683 1054 aa3.73□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A ABF1P14164 731 aa3.73□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A PTP1P25044 335 aa3.73□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A SSZ1P38788 538 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A TAX4P47030 604 aa3.73□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A BNA3P47039 444 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
YMR001C-AYMR001C-A ATG33Q06485 197 aa3.73□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 51.6 ms