RNA–Protein interactions for RNA: YML035C

AMD1, Transcript of AMP deaminase, yeast

Gene AMD1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AMD1	YML035C	CHS1	P08004	1131 aa		6.06	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	DPB3	P27344	201 aa		6.06	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	YEL043W	P32618	956 aa		6.06	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	HEL1	P36113	551 aa		6.06	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	RGD1	P38339	666 aa		6.06	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	TDA3	P38758	523 aa		6.06	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	YHR202W	P38887	602 aa		6.06	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	VPS41	P38959	992 aa		6.06	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	SPC72	P39723	622 aa		6.06	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	YMR1	P47147	688 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.06	□□□□□ -1.44	not detected
AMD1	YML035C	KAP114	P53067	1004 aa		6.06	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	MND1	P53102	219 aa		6.06	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	MAL13	P53338	473 aa		6.06	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	JJJ1	P53863	590 aa		6.06	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	HAP2	P06774	265 aa		6.05	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	SLD2	P34252	453 aa		6.05	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	ATG36	P46983	293 aa		6.05	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	STP1	Q00947	519 aa		6.05	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	SFH1	Q06168	426 aa		6.05	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	GAL80	P04387	435 aa		6.05	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	VPS3	P23643	1011 aa		6.05	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	MRP4	P32902	394 aa		6.05	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	TBS1	P38114	1094 aa		6.05	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	OPT1	P40897	799 aa		6.05	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	POL31	P46957	487 aa		6.05	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	ESC8	Q08119	714 aa		6.05	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	BI2	P03873	423 aa		6.04	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	BI4	P03879	638 aa		6.04	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	TPK1	P06244	397 aa		6.04	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	VBA3	P25594	458 aa		6.04	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	VBA5	P36172	582 aa		6.04	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	GEM1	P39722	662 aa		6.04	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	DSE1	P40077	573 aa		6.04	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	MIC19	P43594	170 aa		6.04	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	HOP2	P53187	214 aa		6.04	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	ATG16	Q03818	150 aa		6.04	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.04	□□□□□ -1.44	not detected
AMD1	YML035C	TRE1	Q08919	783 aa		6.04	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	BI3	Q9ZZW7	517 aa		6.04	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	YLR422W	Q06409	1932 aa		6.04	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	RAD1	P06777	1100 aa		6.04	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	RPO26	P20435	155 aa		6.04	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	HMT1	P38074	348 aa		6.04	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	AGP2	P38090	596 aa		6.04	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	YEL023C	P39992	682 aa		6.04	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	YMR102C	Q03177	834 aa		6.04	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	FRE1	P32791	686 aa		6.03	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	SWE1	P32944	819 aa		6.03	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	SLA2	P33338	968 aa		6.03	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	HIS2	P38635	335 aa		6.03	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	MVP1	P40959	511 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	STB4	P50104	949 aa		6.03	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	SPC98	P53540	846 aa		6.03	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	CIR2	Q08822	631 aa		6.03	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	JIP3	O13555	125 aa		6.03	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	DBF4	P32325	704 aa		6.03	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	RRN6	P32786	894 aa		6.03	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	YBR284W	P38150	797 aa		6.03	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	ARO80	Q04052	950 aa		6.03	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	REC8	Q12188	680 aa		6.03	□□□□□ -1.44
AMD1	YML035C	PDR1	P12383	1068 aa		6.02	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	ADK2	P26364	225 aa		6.02	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	BYE1	P36106	594 aa		6.02	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	CCL1	P37366	393 aa		6.02	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	APN2	P38207	520 aa		6.02	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	RRT2	P38332	387 aa		6.02	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	MSC7	P38694	644 aa		6.02	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	JHD1	P40034	492 aa		6.02	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	ASG1	P40467	964 aa		6.02	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	MAD1	P40957	749 aa		6.02	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	SNZ3	P43545	298 aa		6.02	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	SNZ2	P53824	298 aa		6.02	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	MUB1	Q03162	620 aa		6.02	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	APC5	Q08683	685 aa		6.02	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	YLR462W	O13556	202 aa		6.01	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
AMD1	YML035C	PUT4	P15380	627 aa		6.01	□□□□□ -1.45

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