RNA–Protein interactions for RNA: YLR369W

SSQ1, Transcript of Mitochondrial hsp70-type molecular chaperone, yeastyeast

Gene SSQ1, Length 1,974 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1YLR369W YIR042CP40586 236 aa2.68□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W NOP2P40991 618 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W CHA4P43634 648 aa2.68□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W SCS3P53012 380 aa2.68□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W SRP1Q02821 542 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W TMA10Q06177 86 aa2.68□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W OPI10Q08202 246 aa2.68□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W IRA2P19158 3079 aa2.68□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W POT1P27796 417 aaKnown RBP RIP-Chip data2.67□□□□□ -1.98not detected
SSQ1YLR369W PMI40P29952 429 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W TRM2P33753 639 aa2.67□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W MRP8P35719 219 aa2.67□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W KTR4P38131 464 aa2.67□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W URM1P40554 99 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W IOC3P43596 787 aa2.67□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W MPP10P47083 593 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W NNF1P47149 201 aa2.67□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W GYP7P48365 746 aa2.67□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W MCM6P53091 1017 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W YGR012WP53206 393 aa2.67□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W GTF1P53260 183 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W YML122CQ03207 126 aa2.67□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W YML037CQ03703 340 aa2.67□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W BUL2Q03758 920 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W INM2Q05533 292 aa2.67□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W THI22Q06490 572 aa2.67□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W YDL124WQ07551 312 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W RTT109Q07794 436 aa2.67□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W SNU66Q12420 587 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W PHR1P05066 565 aaKnown RBP RIP-Chip data2.67□□□□□ -1.98not detected
SSQ1YLR369W SPE1P08432 466 aa2.67□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W HSF1P10961 833 aa2.67□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W HCM1P25364 564 aa2.67□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W YUR1P26725 428 aa2.67□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W SWC3P31376 625 aa2.67□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W VBA5P36172 582 aa2.67□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W UBP12P39538 1254 aa2.67□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W SIT1P39980 628 aa2.67□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W PSP2P50109 593 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W IOC4Q04213 475 aa2.67□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W SSF2Q12153 453 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W NTO1Q12311 748 aa2.67□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W MOT1P32333 1867 aa2.66□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W CAN1P04817 590 aa2.66□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W SRP40P32583 406 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W YKL069WP36088 180 aa2.66□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W PBY1P38254 753 aa2.66□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W MBP1P39678 833 aa2.66□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W SAH1P39954 449 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W NPP2P39997 493 aa2.66□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W YKE2P52553 114 aa2.66□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W EXG2P52911 562 aa2.66□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W ART5P53244 586 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W TDA5Q06417 326 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W PUS9Q12069 462 aa2.66□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W SEN1Q00416 2231 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W ENA1P13587 1091 aa2.65□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W UTR4P32626 227 aa2.65□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W SRP101P32916 621 aa2.65□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W CST26P38226 397 aa2.65□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W TSL1P38427 1098 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W CCC2P38995 1004 aa2.65□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W SPF1P39986 1215 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W GCV2P49095 1034 aa2.65□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W ENA2Q01896 1091 aa2.65□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W EMI2Q04409 500 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W DUS3Q06053 668 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W ENA5Q12691 1091 aa2.65□□□□□ -1.98
SSQ1YLR369W POX1P13711 748 aa2.65□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W SEC18P18759 758 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W URK1P27515 501 aa2.65□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W OCA5P38738 679 aa2.65□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W TOM71P38825 639 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W PLB1P39105 664 aa2.65□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W YER158CP40095 573 aa2.65□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W FMP10P40098 244 aa2.65□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W IRR1P40541 1150 aa2.65□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W MSE1P48525 536 aa2.65□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W YGL039WP53183 348 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W YGR125WP53273 1036 aa2.65□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W TPO2P53283 614 aa2.65□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W YNL034WP53963 612 aa2.65□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W YNL018CP53976 612 aa2.65□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W DAK1P54838 584 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W ENB1Q08299 606 aa2.65□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W GUP2Q08929 609 aa2.65□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W KCS1Q12494 1050 aa2.65□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W MYO1P08964 1928 aa2.65□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W RPP0P05317 312 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W RPL40AP0CH08 128 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W RPL40BP0CH09 128 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W AFR1P33304 620 aa2.64□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W DEF1P35732 738 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W SGM1P47166 707 aa2.64□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W HEF3P53978 1044 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W KEL3Q08979 651 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W RTP1Q12751 981 aa2.64□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W PRP9P19736 530 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W CDC48P25694 835 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
SSQ1YLR369W RAD24P32641 659 aa2.63□□□□□ -1.99
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