RNA–Protein interactions for RNA: YGL093W

SPC105, Transcript of Subunit of a kinetochore-microtubule binding complex, yeastyeast

Gene SPC105, Length 2,754 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC105YGL093W XDJ1P39102 459 aa4.37□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W TGL3P40308 642 aa4.37□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W RPL4BP49626 362 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W SPC98P53540 846 aa4.37□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W YNL247WP53852 767 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W UME1Q03010 460 aa4.37□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W REC8Q12188 680 aa4.37□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W APM4Q99186 491 aa4.37□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W YPK1P12688 680 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W PUT4P15380 627 aa4.36□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W RGR1P19263 1082 aa4.36□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W RRT12P25381 491 aa4.36□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W PGS1P25578 521 aa4.36□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W ABD1P32783 436 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W FRE1P32791 686 aa4.36□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W RFS1P38234 210 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W RIM4P38741 713 aa4.36□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W GEM1P39722 662 aa4.36□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W OYE3P41816 400 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W MRX6P48564 524 aa4.36□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W YGR111WP53265 400 aa4.36□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W TPO2P53283 614 aa4.36□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W ATG16Q03818 150 aa4.36□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W GPM2Q12008 311 aa4.36□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W MTF2P10849 440 aa4.36□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W HMG2P12684 1045 aa4.36□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W SPO12P17123 173 aa4.36□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W VBA3P25594 458 aa4.36□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W MRP4P32902 394 aa4.36□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W VBA5P36172 582 aa4.36□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W JNM1P36224 373 aa4.36□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W CDC27P38042 758 aa4.36□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W IES1P43579 692 aa4.36□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W YPL062WQ02781 134 aa4.36□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W ESC2Q06340 456 aa4.36□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W IME1P21190 360 aa4.36□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W DAL2P25335 343 aa4.36□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W PDC6P26263 563 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W YEL043WP32618 956 aa4.36□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W FMP10P40098 244 aa4.36□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W MMM1P41800 426 aa4.36□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W PSP1P50896 841 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W BTN2P53286 410 aa4.36□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W JJJ1P53863 590 aa4.36□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W SNU56Q03782 492 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W EMI2Q04409 500 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W YLR422WQ06409 1932 aa4.35□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W SAT4P25333 603 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W MNR2P35724 969 aa4.35□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W CAJ1P39101 391 aa4.35□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W ATG3P40344 310 aa4.35□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W EFM4P40516 257 aa4.35□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W SNZ3P43545 298 aa4.35□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W SNZ2P53824 298 aa4.35□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W RPL22BP56628 122 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W AIM32Q04689 311 aa4.35□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W PIG1Q06216 648 aa4.35□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W CDD1Q06549 142 aa4.35□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W LEA1Q08963 238 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W PET111P08468 800 aa4.35□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W CAD1P24813 409 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W DSS4P32601 143 aa4.35□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W EXO5P38289 585 aa4.35□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W RCK2P38623 610 aa4.35□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W PCM1P38628 557 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W TCD1P38756 429 aa4.35□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W PEX31P53203 462 aa4.35□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W CEG1Q01159 459 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W ARO80Q04052 950 aa4.35□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W YDR222WQ04925 415 aa4.35□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W YDR344CQ05510 147 aa4.35□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W PMS1P14242 873 aa4.34□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W MTF1P14908 341 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W URK1P27515 501 aa4.34□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W FUI1P38196 639 aa4.34□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W FHL1P39521 936 aa4.34□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data4.34□□□□□ -1.71not detected
SPC105YGL093W MAL13P53338 473 aa4.34□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W SPP1Q03012 353 aa4.34□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W MUB1Q03162 620 aa4.34□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W TFC8Q12308 588 aa4.34□□□□□ -1.71
SPC105YGL093W STE11P23561 717 aa4.34□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W HSP78P33416 811 aa4.34□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W YKL050CP35736 922 aa4.34□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W RTT107P38850 1070 aa4.34□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W SSP1P38871 571 aa4.34□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W LYS9P38999 446 aa4.34□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W ERP2P39704 215 aa4.34□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W BTT1P40314 149 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W JSN1P47135 1091 aaKnown RBP RIP-Chip data4.34□□□□□ -1.72not detected
SPC105YGL093W SML1Q04964 104 aa4.34□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W TAF9Q05027 157 aa4.34□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W VAC14Q06708 880 aa4.34□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W FMP25Q08023 583 aa4.34□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W AIM39Q08223 395 aa4.34□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W VPS5Q92331 675 aa4.34□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W BI2P03873 423 aa4.33□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W BI4P03879 638 aa4.33□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W RAD57P25301 460 aa4.33□□□□□ -1.72
SPC105YGL093W CDC11P32458 415 aa4.33□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 54.8 ms