RNA–Protein interactions for RNA: RDN25-2

RDN25-2, Transcript of 25S ribosomal RNA (25S rRNA), yeastyeast

Gene RDN25-2, Length 3,396 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDN25-2RDN25-2 NPR2P39923 615 aa10.06□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 RRN6P32786 894 aa10.06□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 YKL222CP35995 705 aa10.06□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 DBP7P36120 742 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 YER156CP40093 338 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 NOB1Q08444 459 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 PHO3P24031 467 aa10.06□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 UTP11P34247 250 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 HSM3P38348 480 aa10.06□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 NPT1P39683 429 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 ATP22P50273 684 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 TAF12Q03761 539 aa10.06□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 TMA64Q04600 565 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 ATG17Q06410 417 aa10.06□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 CMP2P14747 604 aa10.05□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 SEN2P16658 377 aa10.05□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 PFK1P16861 987 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 UBA1P22515 1024 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 PEX2P32800 271 aa10.05□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 ARB1P40024 610 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 SPO21Q12411 609 aa10.05□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 OCA4P25366 362 aa10.05□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 ILV6P25605 309 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 HCS1P34243 683 aa10.05□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 YBR242WP38331 238 aa10.05□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 LCP5P40079 357 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 HOP2P53187 214 aa10.05□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 YNL058CP53947 316 aa10.05□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 TRP2P00899 507 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 TRZ1P36159 838 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 PCF11P39081 626 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 RFX1P48743 811 aa10.05□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 LYS4P49367 693 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 PUS6P53294 404 aa10.05□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 AAD16Q02895 342 aa10.05□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 BUG1Q12191 341 aa10.05□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 SIN4P32259 974 aa10.04□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 HXT3P32466 567 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 SNX4P47057 423 aa10.04□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 YPR089WO13585 888 aa10.04□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 RPS7AP26786 190 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 ARC19P33204 171 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 SQT1P35184 431 aa10.04□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 HXT5P38695 592 aa10.04□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 CCT3P39077 534 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 YTA12P40341 825 aa10.04□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 YGR016WP53209 190 aa10.04□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 DIP5P53388 608 aa10.04□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 RPL8AP17076 256 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 OCT1P35999 772 aa10.03□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 TDA3P38758 523 aa10.03□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 SWD1P39706 426 aa10.03□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 SAP185P40856 1058 aa10.03□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 RSC2Q06488 889 aa10.03□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 FRA1Q07825 749 aa10.03□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 PDE2P06776 526 aa10.03□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 GCN3P14741 305 aa10.03□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 UBP9P39967 754 aa10.03□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 NOP9P47077 666 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 RAD17P48581 401 aa10.03□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 LGE1Q02796 332 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 HEL2Q05580 639 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 GAS5Q08193 484 aa10.03□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 CNA1P23287 553 aa10.03□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 AVT6P40074 448 aa10.03□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 YGL176CP46945 554 aa10.03□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 ENT2Q05785 613 aa10.03□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 WRS1Q12109 432 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
RDN25-2RDN25-2 VPH2P32341 215 aa10.02□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 RPC34P32910 317 aa10.02□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 UTP6Q02354 440 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 APM4Q99186 491 aa10.02□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 SEY1Q99287 776 aa10.02□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 RPB2P08518 1224 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 SRV2P17555 526 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 COY1P34237 679 aa10.02□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 VPS21P36017 210 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 SPC42P36094 363 aa10.02□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 APE4P38821 490 aa10.02□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 NOG1Q02892 647 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 VPS36Q06696 566 aa10.02□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 UIP4Q08926 304 aa10.02□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 RKM4Q12504 494 aa10.02□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 YLR462WO13556 202 aa10.01□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 MPH2P0CD99 609 aa10.01□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 YCR016WP25617 290 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 ITR2P30606 609 aa10.01□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 PEX5P35056 612 aa10.01□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 YHL049CP38722 271 aa10.01□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 ERP5P38819 212 aa10.01□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 GAA1P39012 614 aa10.01□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 PIK1P39104 1066 aa10.01□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 OAF1P39720 1047 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 YEL075CP39972 122 aa10.01□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 YER189WP40104 122 aa10.01□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 YFL064CP43540 174 aa10.01□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 ZIP2P53061 704 aa10.01□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 DML1Q03652 475 aa10.01□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 DCS1Q06151 350 aa10.01□□□□□ -0.81
RDN25-2RDN25-2 YBL111CQ3E7Y5 667 aa10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 82.7 ms