RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561408.1

TMOD3-210, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-210ENST00000561408 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 DDB1Q16531 1140 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 GNASQ5JWF2 1037 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 WWC1Q8IX03 1113 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 GPAMQ9HCL2 828 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 LRRC4BQ9NT99 713 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 ADAMTS8Q9UP79 889 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 LMO7Q8WWI1 1683 aa6.9□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 PIK3CDO00329 1044 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 RAD21O60216 631 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 GDF10P55107 478 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 KCNQ4P56696 695 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 TLR1Q15399 786 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 C4orf17Q53FE4 359 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 MSL1Q68DK7 614 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 ACSBG1Q96GR2 724 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 TRERF1Q96PN7 1200 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 MBIPQ9NS73 344 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 NUP155O75694 1391 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 TULP4Q9NRJ4 1543 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 A0A1B0GTH6 734 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 SCNN1DP51172 638 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 FLIIQ13045 1269 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 LYPD4Q6UWN0 246 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
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TMOD3-210ENST00000561408 GPRASP1Q5JY77 1395 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 FOXN1O15353 648 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 INHAP05111 366 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 SKIP12755 728 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 RHBDD1Q8TEB9 315 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 ABHD8Q96I13 439 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 ALG2Q9H553 416 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 RGPD5Q99666 1765 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 ZBTB7CA1YPR0 619 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 ARHGEF15O94989 841 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 KCNMA1Q12791 1236 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 EML3Q32P44 896 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 CRB1P82279 1406 aa6.85□□□□□ -1.31
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TMOD3-210ENST00000561408 MAP3K10Q02779 954 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 FSTL1Q12841 308 aa6.85□□□□□ -1.31
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TMOD3-210ENST00000561408 PRR36Q9H6K5 1346 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 THBS1P07996 1170 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 MX2P20592 715 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 MSX1P28360 303 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 PLA2G4AP47712 749 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 SMTNP53814 917 aa6.84□□□□□ -1.31
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TMOD3-210ENST00000561408 PGBD3Q8N328 593 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-210ENST00000561408 RRAGCQ9HB90 399 aa6.84□□□□□ -1.31
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TMOD3-210ENST00000561408 KCPQ6ZWJ8 1503 aa6.83□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 POM121CA8CG34 1229 aa6.83□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 TMEM229AB2RXF0 380 aa6.83□□□□□ -1.32
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TMOD3-210ENST00000561408 MARSP56192 900 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
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TMOD3-210ENST00000561408 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa6.83□□□□□ -1.32
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TMOD3-210ENST00000561408 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa6.83□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 CD2APQ9Y5K6 639 aa6.83□□□□□ -1.32
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TMOD3-210ENST00000561408 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 PKD1L3Q7Z443 1732 aa6.82□□□□□ -1.32
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TMOD3-210ENST00000561408 RGS19P49795 217 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 GSK3AP49840 483 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 GTF2IP78347 998 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 NCOA4Q13772 614 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 LBRQ14739 615 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 TMEM132AQ24JP5 1023 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 EFHC2Q5JST6 749 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 DEPDC4Q8N2C3 294 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-210ENST00000561408 PRAM1Q96QH2 718 aa6.82□□□□□ -1.32
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