RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473460.1

GINS1-202, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene GINS1, Length 541 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-202ENST00000473460 ACPPP15309 386 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS1-202ENST00000473460 MCTP1Q6DN14 999 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS1-202ENST00000473460 ATCAYQ86WG3 371 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS1-202ENST00000473460 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS1-202ENST00000473460 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
GINS1-202ENST00000473460 KLHDC7BQ96G42 594 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS1-202ENST00000473460 ADAM19Q9H013 955 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS1-202ENST00000473460 ELP3Q9H9T3 547 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS1-202ENST00000473460 CNTN3Q9P232 1028 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS1-202ENST00000473460 KANSL3Q9P2N6 904 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS1-202ENST00000473460 SEPT3Q9UH03 358 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS1-202ENST00000473460 NFKBIEO00221 500 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 GSC2O15499 205 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 DHX15O43143 795 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 UVSSAQ2YD98 709 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 NCAPG2Q86XI2 1143 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 KLHL23Q8NBE8 558 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 UBASH3BQ8TF42 649 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 CEP41Q9BYV8 373 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 SALL4Q9UJQ4 1053 aa7.33□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 DUOXA2Q1HG44 320 aa7.32□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 C7orf69Q9H7B7 122 aa7.32□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 PTPRAP18433 802 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 ATP2B4P23634 1241 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 NFIAQ12857 509 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 TRIM42Q8IWZ5 723 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 MYRFLQ96LU7 910 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 ZMYND15Q9H091 742 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 SEC31BQ9NQW1 1179 aa7.31□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 HMX2A2RU54 273 aa7.3□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 H3BRJ5 948 aa7.3□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 COBLO75128 1261 aa7.3□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 ADAMTS4O75173 837 aa7.3□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 FAM117BQ6P1L5 589 aa7.3□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 XKR5Q6UX68 686 aa7.3□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 ZNF438Q7Z4V0 828 aa7.3□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 C1orf127Q8N9H9 656 aa7.3□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 PBXIP1Q96AQ6 731 aa7.3□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 GGNBP2Q9H3C7 697 aa7.3□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 A6NHS1 94 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 PRR19A6NJB7 356 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 TRPA1O75762 1119 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 SPINK2P20155 84 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 RNF43Q68DV7 783 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 EDEM1Q92611 657 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 HHIPQ96QV1 700 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 CHRDQ9H2X0 955 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 DZANK1Q9NVP4 752 aa7.29□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 PREPP48147 710 aa7.28□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 PIP4K2BP78356 416 aa7.28□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 HGSNATQ68CP4 663 aa7.28□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 FAM20CQ8IXL6 584 aa7.28□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 HELQQ8TDG4 1101 aa7.28□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 WNT8BQ93098 351 aa7.28□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
GINS1-202ENST00000473460 PDGFAP04085 211 aa7.27□□□□□ -1.25
GINS1-202ENST00000473460 FAM83CQ9BQN1 747 aa7.27□□□□□ -1.25
GINS1-202ENST00000473460 DBNDD2Q9BQY9 259 aa7.27□□□□□ -1.25
GINS1-202ENST00000473460 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa7.27□□□□□ -1.25
GINS1-202ENST00000473460 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.27□□□□□ -1.25
GINS1-202ENST00000473460 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa7.27□□□□□ -1.25
GINS1-202ENST00000473460 OSGEPQ9NPF4 335 aa7.27□□□□□ -1.25
GINS1-202ENST00000473460 SOX13Q9UN79 622 aa7.27□□□□□ -1.25
GINS1-202ENST00000473460 CES1P23141 567 aa7.26□□□□□ -1.25
GINS1-202ENST00000473460 GP2P55259 537 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
GINS1-202ENST00000473460 NLRP12P59046 1061 aa7.26□□□□□ -1.25
GINS1-202ENST00000473460 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
GINS1-202ENST00000473460 CLEC10AQ8IUN9 316 aa7.26□□□□□ -1.25
GINS1-202ENST00000473460 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
GINS1-202ENST00000473460 BMP3P12645 472 aa7.25□□□□□ -1.25
GINS1-202ENST00000473460 ANKRD34AQ69YU3 496 aa7.25□□□□□ -1.25
GINS1-202ENST00000473460 SHKBP1Q8TBC3 707 aa7.25□□□□□ -1.25
GINS1-202ENST00000473460 RNF208Q9H0X6 261 aa7.25□□□□□ -1.25
GINS1-202ENST00000473460 FAM177BA6PVY3 158 aa7.24□□□□□ -1.25
GINS1-202ENST00000473460 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
GINS1-202ENST00000473460 MPSTP25325 297 aa7.24□□□□□ -1.25
GINS1-202ENST00000473460 CABP4P57796 275 aa7.24□□□□□ -1.25
GINS1-202ENST00000473460 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
GINS1-202ENST00000473460 BEND4Q6ZU67 534 aa7.24□□□□□ -1.25
GINS1-202ENST00000473460 DTX1Q86Y01 620 aa7.24□□□□□ -1.25
GINS1-202ENST00000473460 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
GINS1-202ENST00000473460 SLC7A3Q8WY07 619 aa7.24□□□□□ -1.25
GINS1-202ENST00000473460 RUSC1Q9BVN2 902 aa7.24□□□□□ -1.25
GINS1-202ENST00000473460 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
GINS1-202ENST00000473460 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
GINS1-202ENST00000473460 IRAK1P51617 712 aa7.23□□□□□ -1.25
GINS1-202ENST00000473460 C8orf34Q49A92 452 aa7.23□□□□□ -1.25
GINS1-202ENST00000473460 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
GINS1-202ENST00000473460 VN1R5Q7Z5H4 357 aa7.23□□□□□ -1.25
GINS1-202ENST00000473460 NXPE3Q969Y0 559 aa7.23□□□□□ -1.25
GINS1-202ENST00000473460 KCNF1Q9H3M0 494 aa7.23□□□□□ -1.25
GINS1-202ENST00000473460 MEGF11A6BM72 1044 aa7.22□□□□□ -1.25
GINS1-202ENST00000473460 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
GINS1-202ENST00000473460 EREGO14944 169 aa7.22□□□□□ -1.25
GINS1-202ENST00000473460 SART1O43290 800 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
GINS1-202ENST00000473460 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms