RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467435.1

HDLBP-231, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 2

Gene HDLBP, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-231	ENST00000467435	ZAP70	P43403	619 aa		14.81	□□□□□ -0.04
HDLBP-231	ENST00000467435	DDR1	Q08345	913 aa		14.81	□□□□□ -0.04
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	14.81	□□□□□ -0.04
HDLBP-231	ENST00000467435	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		14.8	□□□□□ -0.04
HDLBP-231	ENST00000467435	SNAP23	O00161	211 aa		14.8	□□□□□ -0.04
HDLBP-231	ENST00000467435	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	14.8	□□□□□ -0.04
HDLBP-231	ENST00000467435	CHGB	P05060	677 aa		14.8	□□□□□ -0.04
HDLBP-231	ENST00000467435	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	14.8	□□□□□ -0.04
HDLBP-231	ENST00000467435	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	14.8	□□□□□ -0.04
HDLBP-231	ENST00000467435	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		14.8	□□□□□ -0.04
HDLBP-231	ENST00000467435	PI16	Q6UXB8	463 aa		14.8	□□□□□ -0.04
HDLBP-231	ENST00000467435	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	14.8	□□□□□ -0.04
HDLBP-231	ENST00000467435	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		14.8	□□□□□ -0.04
HDLBP-231	ENST00000467435	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		14.8	□□□□□ -0.04
HDLBP-231	ENST00000467435	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	14.8	□□□□□ -0.04
HDLBP-231	ENST00000467435	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
HDLBP-231	ENST00000467435	KCNJ4	P48050	445 aa		14.79	□□□□□ -0.04
HDLBP-231	ENST00000467435	CACNA1S	Q13698	1873 aa		14.79	□□□□□ -0.04
HDLBP-231	ENST00000467435	LAMA4	Q16363	1823 aa		14.79	□□□□□ -0.04
HDLBP-231	ENST00000467435	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		14.79	□□□□□ -0.04
HDLBP-231	ENST00000467435	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		14.79	□□□□□ -0.04
HDLBP-231	ENST00000467435	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
HDLBP-231	ENST00000467435	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	14.79	□□□□□ -0.04
HDLBP-231	ENST00000467435	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		14.79	□□□□□ -0.04
HDLBP-231	ENST00000467435	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		14.79	□□□□□ -0.04
HDLBP-231	ENST00000467435	MAST3	O60307	1309 aa		14.78	□□□□□ -0.04
HDLBP-231	ENST00000467435	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		14.78	□□□□□ -0.04
HDLBP-231	ENST00000467435	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	14.78	□□□□□ -0.04
HDLBP-231	ENST00000467435	GRAP	Q13588	217 aa		14.78	□□□□□ -0.04
HDLBP-231	ENST00000467435	UBE4A	Q14139	1066 aa		14.78	□□□□□ -0.04
HDLBP-231	ENST00000467435	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	14.78	□□□□□ -0.04
HDLBP-231	ENST00000467435	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
HDLBP-231	ENST00000467435	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	14.78	□□□□□ -0.04
HDLBP-231	ENST00000467435	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
HDLBP-231	ENST00000467435	MAP4K1	Q92918	833 aa		14.78	□□□□□ -0.04
HDLBP-231	ENST00000467435	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	14.78	□□□□□ -0.04	1e-6	■■□□□ 12.5
HDLBP-231	ENST00000467435	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	14.77	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	NEK4	P51957	841 aa		14.77	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	NECTIN1	Q15223	517 aa		14.77	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		14.77	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	RASEF	Q8IZ41	740 aa		14.77	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	SPATA5	Q8NB90	893 aa		14.77	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		14.77	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	KCNB2	Q92953	911 aa		14.77	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		14.77	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		14.77	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		14.76	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	LTBP1	Q14766	1721 aa		14.76	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	RASGRF1	Q13972	1273 aa		14.76	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	RNF20	Q5VTR2	975 aa		14.76	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		14.76	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		14.76	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		14.76	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435		M0R2C6	588 aa		14.75	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC27A2	O14975	620 aa		14.75	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	BCAM	P50895	628 aa		14.75	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	WASHC4	Q2M389	1173 aa		14.75	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	CRY2	Q49AN0	593 aa		14.75	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	IL27	Q8NEV9	243 aa		14.75	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	APPBP2	Q92624	585 aa		14.75	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		14.75	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		14.75	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		14.75	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	ADD2	P35612	726 aa		14.74	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	GYG1	P46976	350 aa		14.74	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	MCM2	P49736	904 aa		14.74	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		14.74	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	STK32B	Q9NY57	414 aa		14.74	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	CHD4	Q14839	1912 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	OSBP2	Q969R2	916 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		14.73	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	MMP10	P09238	476 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	PDE6A	P16499	860 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	KLRK1	P26718	216 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	BAG6	P46379	1132 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	UBE3C	Q15386	1083 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC15A2	Q16348	729 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	VPS37D	Q86XT2	251 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		14.72	□□□□□ -0.05
HDLBP-231	ENST00000467435	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		14.72	□□□□□ -0.05

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