RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409937.1

CNGA3-204, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CNGA3, Length 2,615 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-204ENST00000409937 PFKFB2O60825 505 aa16.55■□□□□ 0.24
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CNGA3-204ENST00000409937 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
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CNGA3-204ENST00000409937 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP16.54■□□□□ 0.24
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CNGA3-204ENST00000409937 C1orf167Q5SNV9 1468 aa16.54■□□□□ 0.24
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CNGA3-204ENST00000409937 A0A1B0GVL5 298 aa16.52■□□□□ 0.23
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CNGA3-204ENST00000409937 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
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CNGA3-204ENST00000409937 PALLDQ8WX93 1383 aa16.51■□□□□ 0.23
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CNGA3-204ENST00000409937 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
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CNGA3-204ENST00000409937 H7C1W4 665 aa16.5■□□□□ 0.23
CNGA3-204ENST00000409937 WASHC4Q2M389 1173 aa16.5■□□□□ 0.23
CNGA3-204ENST00000409937 PDCL2Q8N4E4 241 aa16.5■□□□□ 0.23
CNGA3-204ENST00000409937 NKX2-3Q8TAU0 364 aa16.5■□□□□ 0.23
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CNGA3-204ENST00000409937 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
CNGA3-204ENST00000409937 PCDHA7Q9UN72 937 aa16.49■□□□□ 0.23
CNGA3-204ENST00000409937 BECN2A8MW95 431 aa16.49■□□□□ 0.23
CNGA3-204ENST00000409937 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
CNGA3-204ENST00000409937 STX1AQ16623 288 aa16.49■□□□□ 0.23
CNGA3-204ENST00000409937 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
CNGA3-204ENST00000409937 SYNE4Q8N205 404 aa16.49■□□□□ 0.23
CNGA3-204ENST00000409937 SALL1Q9NSC2 1324 aa16.48■□□□□ 0.23
CNGA3-204ENST00000409937 IGSF3O75054 1194 aa16.48■□□□□ 0.23
CNGA3-204ENST00000409937 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
CNGA3-204ENST00000409937 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
CNGA3-204ENST00000409937 DSCC1Q9BVC3 393 aa16.48■□□□□ 0.23
CNGA3-204ENST00000409937 HELLSQ9NRZ9 838 aa16.48■□□□□ 0.23
CNGA3-204ENST00000409937 PRDM4Q9UKN5 801 aa16.48■□□□□ 0.23
CNGA3-204ENST00000409937 ALS2Q96Q42 1657 aa16.48■□□□□ 0.23
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CNGA3-204ENST00000409937 NDUFA8P51970 172 aa16.48■□□□□ 0.23
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CNGA3-204ENST00000409937 RFX7Q2KHR2 1363 aa16.48■□□□□ 0.23
CNGA3-204ENST00000409937 AIFM3Q96NN9 605 aa16.47■□□□□ 0.23
CNGA3-204ENST00000409937 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
CNGA3-204ENST00000409937 TJP1Q07157 1748 aa16.47■□□□□ 0.23
CNGA3-204ENST00000409937 FAM160A1Q05DH4 1040 aa16.47■□□□□ 0.23
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CNGA3-204ENST00000409937 LRRC8AQ8IWT6 810 aa16.47■□□□□ 0.23
CNGA3-204ENST00000409937 KIF1AQ12756 1690 aa16.46■□□□□ 0.23
CNGA3-204ENST00000409937 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa16.46■□□□□ 0.23
CNGA3-204ENST00000409937 KIF28PB7ZC32 967 aa16.46■□□□□ 0.23
CNGA3-204ENST00000409937 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
CNGA3-204ENST00000409937 IL15P40933 162 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
CNGA3-204ENST00000409937 PTPN21Q16825 1174 aa16.46■□□□□ 0.23
CNGA3-204ENST00000409937 DPCR1Q3MIW9 517 aa16.46■□□□□ 0.23
CNGA3-204ENST00000409937 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
CNGA3-204ENST00000409937 C19orf44Q9H6X5 657 aa16.46■□□□□ 0.23
CNGA3-204ENST00000409937 NWD2Q9ULI1 1742 aa16.46■□□□□ 0.23
CNGA3-204ENST00000409937 GOLGA8BA8MQT2 603 aa16.46■□□□□ 0.22
CNGA3-204ENST00000409937 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.22
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