RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP17.94■□□□□ 0.46
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PTPRU-201ENST00000345512 SCRN1Q12765 414 aa17.85■□□□□ 0.45
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PTPRU-201ENST00000345512 SASH1O94885 1247 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRU-201ENST00000345512 FAM193AP78312 1265 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRU-201ENST00000345512 FANCCQ00597 558 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRU-201ENST00000345512 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
PTPRU-201ENST00000345512 CYP21A2P08686 494 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRU-201ENST00000345512 EIF5P55010 431 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
PTPRU-201ENST00000345512 DCAF5Q96JK2 942 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRU-201ENST00000345512 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP17.85■□□□□ 0.45
PTPRU-201ENST00000345512 MYOM1P52179 1685 aa17.84■□□□□ 0.45
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