RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336180.6

LIMK1-201, Transcript of LIM domain kinase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMK1, Length 3,219 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1-201ENST00000336180 APOBRQ0VD83 1088 aa15□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 NKX2-3Q8TAU0 364 aa15□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 SYCE3A1L190 88 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 ZNF34Q8IZ26 560 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 TMEM63CQ9P1W3 806 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 DOT1LQ8TEK3 1739 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 STX6O43752 255 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 BCAMP50895 628 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 GUCY1B3Q02153 619 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 ERFEQ4G0M1 354 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 USP48Q86UV5 1035 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 GRPEL1Q9HAV7 217 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 SLIT2O94813 1529 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 SH3TC1Q8TE82 1336 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 CDC37L1Q7L3B6 337 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 WWC3Q9ULE0 1092 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 PAPPAQ13219 1627 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 RIC1Q4ADV7 1423 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 CIAO1O76071 339 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 CCDC102BQ68D86 513 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 USPL1Q5W0Q7 1092 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 GNPATO15228 680 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 NPHP1O15259 732 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 AKAP2Q9Y2D5 859 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 PDE8BO95263 885 aa14.96□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 PSMA5P28066 241 aa14.96□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 RXRAP19793 462 aa14.96□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 KLHL40Q2TBA0 621 aa14.96□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 TBC1D9BQ66K14 1250 aa14.96□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 MPNDQ8N594 471 aa14.96□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
LIMK1-201ENST00000336180 FSD2A1L4K1 749 aa14.96□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 FOXP2O15409 715 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 MIGA1Q8NAN2 632 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 PLCH1Q4KWH8 1693 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 E7EWF7 191 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 GPAA1O43292 621 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 SMIM22K7EJ46 135 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 GYG1P46976 350 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 MTMR6Q9Y217 621 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 FGAP02671 866 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 VGLL2Q8N8G2 317 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 PLA2G12BQ9BX93 195 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 GPR108Q9NPR9 543 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 ABCF2Q9UG63 623 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 ERVV-1B6SEH8 477 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 KCNB2Q92953 911 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 CHMP4CQ96CF2 233 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 TM6SF1Q9BZW5 370 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 GJB4Q9NTQ9 266 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 ZNF532Q9HCE3 1301 aa14.94□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 PRKAB2O43741 272 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 NTSR2O95665 410 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 F13A1P00488 732 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 KLRK1P26718 216 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 RASGRF1Q13972 1273 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 HMG20BQ9P0W2 317 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 HSPA1LP34931 641 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 CDHR2Q9BYE9 1310 aa14.93□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 SCRN1Q12765 414 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 MAGEB6Q8N7X4 407 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 LRP6O75581 1613 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 BCL9LQ86UU0 1499 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 RBSNQ9H1K0 784 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 ARMT1Q9H993 441 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 COL4A1P02462 1669 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 CHRNDQ07001 517 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 HELLSQ9NRZ9 838 aa14.92□□□□□ -0.02
LIMK1-201ENST00000336180 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms