RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000101395.2

Hoxa4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxa4, Length 1,594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Spg7Q3ULF4 781 aa34.59■■■■□ 3.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mb21d2Q8C525 428 aa34.59■■■■□ 3.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 VirmaA2AIV2 1811 aaKnown RBP34.59■■■■□ 3.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ifit2Q64112 472 aa34.58■■■■□ 3.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mrps27Q8BK72 415 aaKnown RBP34.58■■■■□ 3.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Appbp2Q9DAX9 585 aa34.58■■■■□ 3.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fam71e1A1L3C1 212 aa34.57■■■■□ 3.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ms4a2P20490 235 aa34.57■■■■□ 3.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ppp1r9bQ6R891 817 aaKnown RBP34.57■■■■□ 3.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1700010I14RikQ7TPG0 532 aa34.57■■■■□ 3.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 FliiQ9JJ28 1271 aa34.57■■■■□ 3.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pram1Q6BCL1 675 aa34.57■■■■□ 3.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 StrbpQ91WM1 672 aaKnown RBP34.57■■■■□ 3.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zfp831A2ADM8 1628 aa34.57■■■■□ 3.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Sptbn5F6UCX4 1208 aa34.56■■■■□ 3.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Sept9Q80UG5 583 aa34.56■■■■□ 3.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Dnai1Q8C0M8 701 aa34.56■■■■□ 3.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Znrd1-asQ8R0E5 213 aa34.56■■■■□ 3.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ube3cQ80U95 1083 aa34.55■■■■□ 3.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Jakmip1Q8BVL9 626 aa34.55■■■■□ 3.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Adam1bQ8R534 806 aa34.55■■■■□ 3.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tuft1O08970 390 aa34.54■■■■□ 3.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mlh1Q9JK91 760 aa34.54■■■■□ 3.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Stat5bP42232 786 aa34.53■■■■□ 3.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ppp1r21Q3TDD9 780 aa34.53■■■■□ 3.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gdf11Q9Z1W4 405 aa34.53■■■■□ 3.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 EvplQ9D952 2035 aa34.53■■■■□ 3.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cyp2d10P24456 504 aa34.53■■■■□ 3.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ccdc51Q3URS9 406 aa34.53■■■■□ 3.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ciapin1Q8WTY4 309 aa34.53■■■■□ 3.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mast3Q3U214 1321 aa34.52■■■■□ 3.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Myh15E9Q264 1925 aa34.52■■■■□ 3.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pla2g4fQ50L41 855 aa34.52■■■■□ 3.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pdzph1Q8BGR1 1238 aa34.52■■■■□ 3.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ttc5Q99LG4 440 aa34.52■■■■□ 3.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pus3Q9JI38 481 aa34.52■■■■□ 3.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Arfgef1G3X9K3 1846 aaKnown RBP34.51■■■■□ 3.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Vsig10D3YX43 558 aa34.51■■■■□ 3.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tgfb2P27090 414 aa34.51■■■■□ 3.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Edrf1Q6GQV7 1239 aa34.51■■■■□ 3.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rbm15bQ6PHZ5 887 aaKnown RBP34.51■■■■□ 3.12
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Itgb4A2A863 1818 aa34.5■■■■□ 3.11
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zkscan16A2ALW2 728 aa34.5■■■■□ 3.11
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kif22Q3V300 660 aa34.5■■■■□ 3.11
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tnpo1Q8BFY9 898 aaKnown RBP34.5■■■■□ 3.11
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 EngaseQ8BX80 734 aa34.5■■■■□ 3.11
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ak2Q9WTP6 239 aa34.5■■■■□ 3.11
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Carmil3Q3UFQ8 1375 aa34.5■■■■□ 3.11
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rbm8a2A0A0N4SUH6 174 aa34.49■■■■□ 3.11
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rbm8aQ9CWZ3 174 aa34.49■■■■□ 3.11
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Letm1Q9Z2I0 738 aa34.49■■■■□ 3.11
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Myh7Q91Z83 1935 aa34.49■■■■□ 3.11
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Myh3P13541 1940 aa34.49■■■■□ 3.11
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Myh4Q5SX39 1939 aa34.49■■■■□ 3.11
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rnf20Q5DTM8 973 aa34.49■■■■□ 3.11
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gpr150Q8BL07 427 aa34.49■■■■□ 3.11
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zswim8Q3UHH1 1832 aaKnown RBP34.48■■■■□ 3.11
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Krt40Q6IFX3 439 aa34.48■■■■□ 3.11
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fchsd1Q6PFY1 688 aa34.48■■■■□ 3.11
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 AidaQ8C4Q6 305 aa34.48■■■■□ 3.11
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 CpdO89001 1377 aa34.48■■■■□ 3.11
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ltn1Q6A009 1767 aa34.47■■■■□ 3.11
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 RubcnlQ3TD16 648 aa34.47■■■■□ 3.11
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ptcd1Q8C2E4 695 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 MthfsQ9D110 203 aa34.47■■■■□ 3.11
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Csrnp1P59054 583 aa34.46■■■■□ 3.11
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Trmt44Q9D2Q2 713 aa34.46■■■■□ 3.11
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Add2Q9QYB8 725 aa34.46■■■■□ 3.11
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Sytl4Q9R0Q1 673 aa34.46■■■■□ 3.11
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Hmg20bQ9Z104 317 aa34.46■■■■□ 3.11
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Frmpd3A0A140LIW3 1774 aa34.46■■■■□ 3.11
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr247E9PVJ7 320 aa34.45■■■■□ 3.11
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr819K7N727 320 aa34.45■■■■□ 3.11
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 LlphQ9D945 130 aaKnown RBP34.45■■■■□ 3.11
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cyp2c67Q569X9 491 aa34.45■■■■□ 3.1
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfm5Q8BU90 496 aa34.45■■■■□ 3.1
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 AnlnQ8K298 1121 aaKnown RBP34.45■■■■□ 3.1
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mapkapk5O54992 473 aa34.44■■■■□ 3.1
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Atp6v1aP50516 617 aaKnown RBP34.44■■■■□ 3.1
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Washc4Q3UMB9 1173 aa34.44■■■■□ 3.1
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Insm1Q63ZV0 521 aa34.44■■■■□ 3.1
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tshz3Q8CGV9 1081 aa34.44■■■■□ 3.1
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lmbrd2Q8C561 694 aa34.43■■■■□ 3.1
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rbbp6P97868 1790 aaKnown RBP34.42■■■■□ 3.1
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Hspd1P63038 573 aaKnown RBP34.42■■■■□ 3.1
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kank4Q6P9J5 1016 aa34.41■■■■□ 3.1
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pcdhb9E9Q5G2 828 aa34.4■■■■□ 3.1
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Trim56Q80VI1 734 aaKnown RBP34.4■■■■□ 3.1
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cxcl11Q9JHH5 100 aa34.4■■■■□ 3.1
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lrrfip2Q91WK0 415 aa34.4■■■■□ 3.1
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 RarsQ9D0I9 660 aaKnown RBP34.4■■■■□ 3.1
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Myoz2Q9JJW5 264 aa34.4■■■■□ 3.1
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Alx1Q8C8B0 326 aa34.39■■■■□ 3.1
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Atf7Q8R0S1 413 aa34.39■■■■□ 3.1
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kdm4cQ8VCD7 1054 aa34.39■■■■□ 3.1
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Frmd7A2AD83 703 aa34.38■■■■□ 3.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 ChgaP26339 463 aaKnown RBP34.38■■■■□ 3.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tmed8Q3UHI4 326 aa34.38■■■■□ 3.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tex2Q6ZPJ0 1128 aaKnown RBP34.38■■■■□ 3.09
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Usp44Q8C2S0 711 aa34.38■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15.7 ms