RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021990.3

Ptdss1-201, Transcript of Phosphatidylserine synthase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptdss1, Length 3,424 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Adamtsl3G3UXC7 1706 aa16.87■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Nfat5Q9WV30 1534 aa16.87■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Atp2b3Q0VF55 1220 aa16.87■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Myl10Q62082 202 aa16.87■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Agtpbp1Q641K1 1218 aa16.87■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Oxsr1Q6P9R2 527 aa16.87■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Cnot6lQ8VEG6 555 aa16.87■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Als2Q920R0 1651 aa16.87■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Slu7Q8BHJ9 585 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Arid5bQ8BM75 1188 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Smim5Q8BT42 78 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 SnrkQ8VDU5 748 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Abl1P00520 1123 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Morc2aQ69ZX6 1030 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Stx1aO35526 288 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 PnnO35691 725 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Sass6Q80UK7 654 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ints5Q8CHT3 1018 aa16.86■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Oas2E9Q9A9 742 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Tbc1d31Q6NXY1 996 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Cdc45Q9Z1X9 566 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Gm12185Q5NCB2 835 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Trim52Q8CDV4 233 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Osbpl5Q9ER64 874 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Tbc1d4Q8BYJ6 1307 aa16.85■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Cers3Q1A3B0 383 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Asap2Q7SIG6 958 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Acnat2Q8BGG9 420 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 ImmtQ8CAQ8 757 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 TrdnE9Q9K5 693 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Atp2b1G5E829 1220 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 TsksO54887 585 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ftl2P49945 183 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Cplx2P84086 134 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Nxf2Q4ZGD8 691 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Cyp7a1Q64505 503 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Luzp1Q8R4U7 1068 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ccne2Q9Z238 404 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Dnajc14Q921R4 703 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Usp42B2RQC2 1324 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Slc4a1P04919 929 aa16.83■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Prpf4bQ61136 1007 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ttc27Q8CD92 847 aa16.83■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Col4a3bpQ9EQG9 624 aa16.83■□□□□ 0.29
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Sipa1l2Q80TE4 1722 aa16.83■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Nlrp3Q8R4B8 1033 aa16.83■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Zscan29E9Q5B4 869 aa16.83■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Dnm1P39053 867 aa16.83■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 RubcnlQ3TD16 648 aa16.83■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Plcd3Q8K2J0 785 aa16.83■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Hps3Q91VB4 1002 aa16.83■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ssfa2Q922B9 1252 aa16.83■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Clic4Q9QYB1 253 aa16.83■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Scn7aB1AYL1 1681 aa16.82■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Pla2g4fQ50L41 855 aa16.82■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ano10Q8BH79 659 aa16.82■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Rps6ka5Q8C050 863 aa16.82■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Bmp2kQ91Z96 1138 aa16.82■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Gpr182P43142 395 aa16.82■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Rapgef3Q8VCC8 918 aa16.82■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Vmn2r23E9PXI5 849 aa16.82■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Pram1Q6BCL1 675 aa16.82■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ncaph2Q8BSP2 607 aa16.82■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Atad2Q8CDM1 1040 aa16.82■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 AK157302I3ITR1 129 aa16.81■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Tnni2P13412 182 aa16.81■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Zhx1P70121 873 aa16.81■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Gtf2f1Q3THK3 508 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Isca1Q9D924 129 aa16.81■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Stxbp4Q9WV89 557 aa16.81■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Lekr1B2RVN1 116 aa16.81■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Cyp2d34L7N463 504 aa16.81■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Clec11aO88200 328 aa16.81■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Sptlc2P97363 560 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Acap3Q6NXL5 833 aa16.81■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Emilin1Q99K41 1017 aa16.81■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Metap2O08663 478 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Cops6O88545 324 aa16.8■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Rims2Q9EQZ7 1530 aa16.8■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Nid2O88322 1403 aa16.8■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Trim34bJ3QNR8 485 aa16.8■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Ccdc47Q9D024 483 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Sos2Q02384 1333 aa16.8■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Hmx1O70218 332 aa16.8■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Col14a1Q80X19 1797 aa16.8■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 CebpaP53566 359 aa16.79■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Nlrp9aQ66X03 949 aa16.79■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Tbc1d30Q69ZT9 766 aa16.79■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Znf653Q6YND2 615 aa16.79■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 CerkQ8K4Q7 531 aa16.79■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Zbtb43Q9DAI4 467 aa16.79■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Appbp2Q9DAX9 585 aa16.79■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Dusp10Q9ESS0 483 aa16.79■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Fam160b2Q80YR2 744 aa16.79■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Rbm33Q9CXK9 1231 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Rgs9O54828 675 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 NapbP28663 298 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 MpndQ3TV65 487 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Zkscan4Q5SZT6 480 aa16.78■□□□□ 0.28
Ptdss1-201ENSMUST00000021990 Smarcc2Q6PDG5 1213 aa16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 47.7 ms