RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 COX6B1P14854 86 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 MYL9P24844 172 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 GRNP28799 593 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 CALCRP30988 508 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 THBS4P35443 961 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 GSK3AP49840 483 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 PPP3R1P63098 170 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 FAM3AP98173 230 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 HGFACQ04756 655 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 DOC2BQ14184 412 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 SSX1Q16384 188 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 GFOD2Q3B7J2 385 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 SNAI3Q3KNW1 292 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 FAM209AQ5JX71 171 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 C22orf34Q6ZV56 151 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 CEACAM19Q7Z692 300 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 CDH26Q8IXH8 852 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 ZFP41Q8N8Y5 198 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 SLC25A40Q8TBP6 338 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 TMEM106AQ96A25 262 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 DIRC2Q96SL1 478 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 DHRS9Q9BPW9 319 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 FUNDC2Q9BWH2 189 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 OR2J1Q9GZK6 312 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 CA10Q9NS85 328 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 EDARQ9UNE0 448 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 FOXJ3Q9UPW0 622 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 MPC1Q9Y5U8 109 aa8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 PLCE1Q9P212 2302 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 CADP27708 2225 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 PLSCR5A0PG75 271 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 ANXA2P2A6NMY6 339 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 A6NNC1 897 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 CD300LBA8K4G0 201 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 DEFB108AA8MXU0 73 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 IQCF6A8MYZ5 107 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 GABRPO00591 440 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 SLC22A1O15245 554 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 GMDSO60547 372 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 GABARAPO95166 117 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 UCHL1P09936 223 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 FSTP19883 344 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 PRKACBP22694 351 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 TGFBR2P37173 567 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 CRYBB2P43320 205 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 CAPZA1P52907 286 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 RPS25P62851 125 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 ZNF92Q03936 586 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 EFNB3Q15768 340 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 HSD17B12Q53GQ0 312 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 CLVS2Q5SYC1 327 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 UTS2BQ765I0 119 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 SATL1Q86VE3 508 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 NKAIN3Q8N8D7 197 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 KBTBD8Q8NFY9 601 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 OR14K1Q8NGZ2 314 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 OR13G1Q8NGZ3 307 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 TMEM171Q8WVE6 324 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 TMEM203Q969S6 136 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 SPSB1Q96BD6 273 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 CMBLQ96DG6 245 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 PIK3IP1Q96FE7 263 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 DERL3Q96Q80 235 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 CHST5Q9GZS9 411 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 PLK3Q9H4B4 646 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 TCF7L1Q9HCS4 588 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 SNTG1Q9NSN8 517 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 PTTG3PQ9NZH4 202 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 ZNF319Q9P2F9 582 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 SLC7A11Q9UPY5 501 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 PIGLQ9Y2B2 252 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 PRR14LQ5THK1 2151 aa8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa8□□□□□ -1.13
CS-220ENST00000550700 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa8□□□□□ -1.13
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