RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 MUC15Q8N387 334 aa23.8■■□□□ 1.4
GIPC1-201ENST00000345425 FTMTQ8N4E7 242 aa23.8■■□□□ 1.4
GIPC1-201ENST00000345425 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa23.8■■□□□ 1.4
GIPC1-201ENST00000345425 OR56B2PQ8NGI1 322 aa23.8■■□□□ 1.4
GIPC1-201ENST00000345425 V9GYS6 101 aa23.8■■□□□ 1.4
GIPC1-201ENST00000345425 IQCF6A8MYZ5 107 aa23.79■■□□□ 1.4
GIPC1-201ENST00000345425 H3BSH0 61 aa23.79■■□□□ 1.4
GIPC1-201ENST00000345425 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
GIPC1-201ENST00000345425 EFNB3Q15768 340 aa23.79■■□□□ 1.4
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF611Q8N823 705 aa23.79■■□□□ 1.4
GIPC1-201ENST00000345425 OR14K1Q8NGZ2 314 aa23.79■■□□□ 1.4
GIPC1-201ENST00000345425 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
GIPC1-201ENST00000345425 TMED9Q9BVK6 235 aa23.79■■□□□ 1.4
GIPC1-201ENST00000345425 UBTD1Q9HAC8 227 aa23.79■■□□□ 1.4
GIPC1-201ENST00000345425 PLEKHA1Q9HB21 404 aa23.79■■□□□ 1.4
GIPC1-201ENST00000345425 NDUFB11Q9NX14 153 aa23.79■■□□□ 1.4
GIPC1-201ENST00000345425 GPR160Q9UJ42 338 aa23.79■■□□□ 1.4
GIPC1-201ENST00000345425 A0A1W2PPW3 197 aa23.78■■□□□ 1.4
GIPC1-201ENST00000345425 B9A039 149 aa23.78■■□□□ 1.4
GIPC1-201ENST00000345425 GABRA5P31644 462 aa23.78■■□□□ 1.4
GIPC1-201ENST00000345425 LIPAP38571 399 aa23.78■■□□□ 1.4
GIPC1-201ENST00000345425 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa23.78■■□□□ 1.4
GIPC1-201ENST00000345425 SSX1Q16384 188 aa23.78■■□□□ 1.4
GIPC1-201ENST00000345425 OR51A4Q8NGJ6 313 aa23.78■■□□□ 1.4
GIPC1-201ENST00000345425 OR13C3Q8NGS6 347 aa23.78■■□□□ 1.4
GIPC1-201ENST00000345425 OR10AC1Q8NH08 325 aa23.78■■□□□ 1.4
GIPC1-201ENST00000345425 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
GIPC1-201ENST00000345425 DHDHQ9UQ10 334 aa23.78■■□□□ 1.4
GIPC1-201ENST00000345425 C10orf35Q96D05 121 aa23.78■■□□□ 1.4
GIPC1-201ENST00000345425 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
GIPC1-201ENST00000345425 PIGLQ9Y2B2 252 aa23.78■■□□□ 1.4
GIPC1-201ENST00000345425 SERPINA3P01011 423 aa23.77■■□□□ 1.4
GIPC1-201ENST00000345425 OCM2P0CE71 109 aa23.77■■□□□ 1.4
GIPC1-201ENST00000345425 ACKR3P25106 362 aa23.77■■□□□ 1.4
GIPC1-201ENST00000345425 TNK1Q13470 666 aa23.77■■□□□ 1.4
GIPC1-201ENST00000345425 ZBTB37Q5TC79 503 aa23.77■■□□□ 1.4
GIPC1-201ENST00000345425 AGAP6Q5VW22 663 aa23.77■■□□□ 1.4
GIPC1-201ENST00000345425 OR5AS1Q8N127 324 aa23.77■■□□□ 1.4
GIPC1-201ENST00000345425 BHLHE23Q8NDY6 225 aa23.77■■□□□ 1.4
GIPC1-201ENST00000345425 THRSPQ92748 146 aa23.77■■□□□ 1.4
GIPC1-201ENST00000345425 TAAR3PQ9P1P4 343 aa23.77■■□□□ 1.4
GIPC1-201ENST00000345425 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
GIPC1-201ENST00000345425 TFAP2AP05549 437 aa23.76■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 CD2P06729 351 aa23.76■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP23.76■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 NKPD1Q17RQ9 610 aa23.76■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 Q499Y3 187 aa23.76■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM255AQ5JRV8 349 aa23.76■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa23.76■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 ENPP5Q9UJA9 477 aa23.76■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 PLSCR5A0PG75 271 aa23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 RPS25P62851 125 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 ALKBH6Q3KRA9 238 aa23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 OR8G5Q8NG78 346 aa23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 OR13C5Q8NGS8 318 aa23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM203Q969S6 136 aa23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 CYSLTR2Q9NS75 346 aa23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 PTPN13Q12923 2485 aa23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 HLA-DPB1P04440 258 aa23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 C20orf204Q6ZNR8 217 aa23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 CBLN4Q9NTU7 201 aa23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 DANCRP0C864 163 aa23.74■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 FAHP16930 419 aa23.74■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF20P17024 532 aa23.74■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 RPL5P46777 297 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 ALDH3B2P48448 385 aa23.74■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 ZMAT1Q5H9K5 638 aa23.74■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 CD36P16671 472 aa23.73■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 SOX2P48431 317 aa23.73■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 SWI5Q1ZZU3 235 aa23.73■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF787Q6DD87 383 aa23.73■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa23.73■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 DTX2Q86UW9 622 aa23.73■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM106AQ96A25 262 aa23.73■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 OR14A2Q96R54 314 aa23.73■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 SLC22A4Q9H015 551 aa23.73■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF879B4DU55 563 aa23.73■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 M0R233 179 aa23.73■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 MMP15P51511 669 aa23.73■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 MST1LQ2TV78 715 aa23.73■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 KRT74Q7RTS7 529 aa23.73■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 OR13F1Q8NGS4 319 aa23.73■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 FGGYQ96C11 551 aa23.73■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM100Q9NV29 134 aa23.73■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 LMX1BO60663 402 aa23.72■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 GATBO75879 557 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
GIPC1-201ENST00000345425 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms