RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 SHC1P29353 583 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 SFTPDP35247 375 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 DNASE1L1P49184 302 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 CCR9P51686 369 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 BIDP55957 195 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 OR2B6P58173 313 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 B3GALT5-AS1P59052 145 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 H3F3AP84243 136 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 MFAP5Q13361 173 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 OR1C1Q15619 314 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 INAQ16352 499 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 C3AR1Q16581 482 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 MS4A18Q3C1V0 323 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 SPANXN2Q5MJ10 180 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 THEM4Q5T1C6 240 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 HBMQ6B0K9 141 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 DEGS2Q6QHC5 323 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 GFRALQ6UXV0 394 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 CCDC190Q86UF4 302 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 GHDCQ8N2G8 530 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 SYT14Q8NB59 555 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 SLC26A10Q8NG04 563 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 OR14L1PQ8NHC6 308 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 ZNRF4Q8WWF5 429 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 ACOT12Q8WYK0 555 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 TMEM203Q969S6 136 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 CEP19Q96LK0 163 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 SFXN2Q96NB2 322 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 TSSK2Q96PF2 358 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 SH3GL3Q99963 347 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 CCDC32Q9BV29 185 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 COMMD4Q9H0A8 199 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 MOB1AQ9H8S9 216 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 QPCTLQ9NXS2 382 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 KLHL9Q9P2J3 617 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 TINAGQ9UJW2 476 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 SLC45A2Q9UMX9 530 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 MPDZO75970 2070 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 ISPDA4D126 451 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 TVP23AA6NH52 213 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 CD8B2A6NJW9 211 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 PRR32B1ATL7 298 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 E9PI62 339 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 NPIPA2E9PIF3 369 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 NPIPA3F8WFD2 350 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 G3V3Y1 287 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 ZIC3O60481 467 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 UPK3AO75631 287 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 UCHL1P09936 223 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 OR8G3PP0DMU2 310 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 HLA-DOBP13765 273 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 ZNF823P16415 610 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 AGAP20933 346 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 MALP21145 153 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 CALRP27797 417 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 SDC2P34741 201 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 PPP5CP53041 499 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 PPP3R1P63098 170 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 SLC3A1Q07837 685 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 FOXO1Q12778 655 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 HIST3H3Q16695 136 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 HYAL4Q2M3T9 481 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 ZNF181Q2M3W8 571 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 RGS21Q2M5E4 152 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 C10orf128Q5T292 105 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 PDSS1Q5T2R2 415 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 LIPNQ5VXI9 398 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 MZT2AQ6P582 158 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 NHLRC1Q6VVB1 395 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 TMEM91Q6ZNR0 172 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 DPY19L4Q7Z388 723 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 GPAT4Q86UL3 456 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 ZNF679Q8IYX0 411 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 YIPF7Q8N8F6 280 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 MDS2Q8NDY4 140 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 OR2M7Q8NG81 312 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 OR5M1Q8NGP8 315 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 OR2V1Q8NHB1 315 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 GHSRQ92847 366 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
CCL20-202ENST00000409189 ADGRG7Q96K78 797 aa5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms