RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	POU4F2	Q12837	409 aa		21.43	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	EFNB3	Q15768	340 aa		21.43	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		21.43	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		21.43	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		21.43	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	KRT77	Q7Z794	578 aa		21.43	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	SETD9	Q8NE22	299 aa		21.43	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		21.43	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	21.43	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229		Q96MT0	163 aa		21.43	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	KCNJ15	Q99712	375 aa		21.43	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	21.43	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	POFUT1	Q9H488	388 aa		21.43	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		21.43	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		21.43	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	PDZD2	O15018	2839 aa		21.43	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		21.42	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	PSMD9	O00233	223 aa		21.42	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	SBK2	P0C263	348 aa		21.42	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	CAPG	P40121	348 aa		21.42	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	CX3CR1	P49238	355 aa		21.42	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	RIPK1	Q13546	671 aa		21.42	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	OCLN	Q16625	522 aa		21.42	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF691	Q5VV52	312 aa		21.42	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	21.42	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		21.42	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		21.42	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	21.42	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	RNFT2	Q96EX2	444 aa		21.42	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	21.42	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	COG8	Q96MW5	612 aa		21.42	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		21.42	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	21.42	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	COPS3	Q9UNS2	423 aa		21.42	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	STARD10	Q9Y365	291 aa		21.42	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	ICMT	O60725	284 aa		21.41	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	21.41	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	SLC2A1	P11166	492 aa		21.41	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	MPV17	P39210	176 aa		21.41	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	MTNR1A	P48039	350 aa		21.41	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	PTH2R	P49190	550 aa		21.41	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	AQP4	P55087	323 aa		21.41	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	CXCR4	P61073	352 aa		21.41	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	21.41	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		21.41	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	21.41	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	MST1L	Q2TV78	715 aa		21.41	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	NAA40	Q86UY6	237 aa		21.41	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		21.41	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	MBD6	Q96DN6	1003 aa		21.41	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	21.41	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	BRD7	Q9NPI1	651 aa		21.41	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		21.41	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	NOTCH2	Q04721	2471 aa		21.4	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	PHYH	O14832	338 aa		21.4	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	TBX1	O43435	398 aa		21.4	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF250	P15622	560 aa		21.4	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	GABRB1	P18505	474 aa		21.4	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	ALOX5AP	P20292	161 aa		21.4	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	ALDH3B1	P43353	468 aa		21.4	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	ATP5J2	P56134	94 aa		21.4	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	21.4	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	TMED1	Q13445	227 aa		21.4	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		21.4	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		21.4	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	DRAM2	Q6UX65	266 aa		21.4	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		21.4	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		21.4	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	21.4	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	SNX33	Q8WV41	574 aa		21.4	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		21.4	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	DOK1	Q99704	481 aa		21.4	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229	LRP12	Q9Y561	859 aa		21.4	■■□□□ 1.02
GPS1-223	ENST00000584229		M0R233	179 aa		21.39	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	OPRL1	P41146	370 aa		21.39	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	MALL	Q13021	153 aa		21.39	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	21.39	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		21.39	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		21.39	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	MNT	Q99583	582 aa		21.39	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		21.39	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	MRO	Q9BYG7	248 aa		21.39	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		21.39	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	GPR160	Q9UJ42	338 aa		21.39	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		21.39	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	USF3	Q68DE3	2245 aa		21.39	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM129	A0AVI4	362 aa		21.38	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229		H0YAE9	185 aa		21.38	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229		J3QW42	95 aa		21.38	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	OVOL3	O00110	214 aa		21.38	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	21.38	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	APOC1	P02654	83 aa		21.38	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	ADRA2A	P08913	450 aa		21.38	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF91	Q05481	1191 aa		21.38	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	IL18R1	Q13478	541 aa		21.38	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	21.38	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		21.38	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	21.38	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		21.38	■■□□□ 1.01
GPS1-223	ENST00000584229	APH1B	Q8WW43	257 aa		21.38	■■□□□ 1.01

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