RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560983.1

HERC1-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, humanhuman

TSL 2

Gene HERC1, Length 457 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1-211ENST00000560983 VAMP5O95183 116 aa2.95□□□□□ -1.94
HERC1-211ENST00000560983 SNAP29O95721 258 aa2.95□□□□□ -1.94
HERC1-211ENST00000560983 RAB36O95755 333 aa2.95□□□□□ -1.94
HERC1-211ENST00000560983 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
HERC1-211ENST00000560983 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
HERC1-211ENST00000560983 PAX6P26367 422 aa2.95□□□□□ -1.94
HERC1-211ENST00000560983 KRTAP5-9P26371 169 aa2.95□□□□□ -1.94
HERC1-211ENST00000560983 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
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HERC1-211ENST00000560983 PMELP40967 661 aa2.95□□□□□ -1.94
HERC1-211ENST00000560983 CRATP43155 626 aa2.95□□□□□ -1.94
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HERC1-211ENST00000560983 C2orf80Q0P641 193 aa2.95□□□□□ -1.94
HERC1-211ENST00000560983 PMS2P3Q13401 168 aa2.95□□□□□ -1.94
HERC1-211ENST00000560983 CAMK2DQ13557 499 aa2.95□□□□□ -1.94
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HERC1-211ENST00000560983 METTL11BQ5VVY1 283 aa2.95□□□□□ -1.94
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HERC1-211ENST00000560983 FAM71E1Q6IPT2 247 aa2.95□□□□□ -1.94
HERC1-211ENST00000560983 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.95□□□□□ -1.94
HERC1-211ENST00000560983 EMBQ6PCB8 327 aa2.95□□□□□ -1.94
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HERC1-211ENST00000560983 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
HERC1-211ENST00000560983 Q6ZR03 302 aa2.95□□□□□ -1.94
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HERC1-211ENST00000560983 C20orf196Q8IYI0 205 aa2.95□□□□□ -1.94
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HERC1-211ENST00000560983 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
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HERC1-211ENST00000560983 MS4A18H0YCH9 400 aa2.94□□□□□ -1.94
HERC1-211ENST00000560983 M0R3G1 203 aa2.94□□□□□ -1.94
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HERC1-211ENST00000560983 UBL3O95164 117 aa2.94□□□□□ -1.94
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HERC1-211ENST00000560983 IFT88Q13099 833 aa2.94□□□□□ -1.94
HERC1-211ENST00000560983 HNF4GQ14541 408 aa2.94□□□□□ -1.94
HERC1-211ENST00000560983 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
HERC1-211ENST00000560983 NPTX1Q15818 432 aa2.94□□□□□ -1.94
HERC1-211ENST00000560983 ZNF141Q15928 474 aa2.94□□□□□ -1.94
HERC1-211ENST00000560983 MAPK14Q16539 360 aa2.94□□□□□ -1.94
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