RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476467.1

PSMB4-204, Transcript of proteasome subunit beta 4, humanhuman

TSL 2

Gene PSMB4, Length 2,067 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4-204ENST00000476467 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa11.66□□□□□ -0.54
PSMB4-204ENST00000476467 INPP5EQ9NRR6 644 aa11.66□□□□□ -0.54
PSMB4-204ENST00000476467 BABAM2Q9NXR7 383 aa11.66□□□□□ -0.54
PSMB4-204ENST00000476467 MALT1Q9UDY8 824 aa11.66□□□□□ -0.54
PSMB4-204ENST00000476467 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PSMB4-204ENST00000476467 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PSMB4-204ENST00000476467 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PSMB4-204ENST00000476467 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa11.65□□□□□ -0.54
PSMB4-204ENST00000476467 SHISA3A0PJX4 238 aa11.65□□□□□ -0.54
PSMB4-204ENST00000476467 CASKO14936 926 aa11.65□□□□□ -0.54
PSMB4-204ENST00000476467 SSX4O60224 188 aa11.65□□□□□ -0.54
PSMB4-204ENST00000476467 SLC16A7O60669 478 aa11.65□□□□□ -0.54
PSMB4-204ENST00000476467 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PSMB4-204ENST00000476467 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PSMB4-204ENST00000476467 IGHV3-9P01782 118 aa11.65□□□□□ -0.54
PSMB4-204ENST00000476467 APOA1P02647 267 aa11.65□□□□□ -0.54
PSMB4-204ENST00000476467 SPI1P17947 270 aa11.65□□□□□ -0.54
PSMB4-204ENST00000476467 CAV3P56539 151 aa11.65□□□□□ -0.54
PSMB4-204ENST00000476467 GALEQ14376 348 aa11.65□□□□□ -0.54
PSMB4-204ENST00000476467 STK11Q15831 433 aa11.65□□□□□ -0.54
PSMB4-204ENST00000476467 BAK1Q16611 211 aa11.65□□□□□ -0.54
PSMB4-204ENST00000476467 C4orf17Q53FE4 359 aa11.65□□□□□ -0.54
PSMB4-204ENST00000476467 C10orf128Q5T292 105 aa11.65□□□□□ -0.54
PSMB4-204ENST00000476467 MTFR2Q6P444 385 aa11.65□□□□□ -0.54
PSMB4-204ENST00000476467 LRFN4Q6PJG9 635 aa11.65□□□□□ -0.54
PSMB4-204ENST00000476467 TMEM91Q6ZNR0 172 aa11.65□□□□□ -0.54
PSMB4-204ENST00000476467 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PSMB4-204ENST00000476467 FJX1Q86VR8 437 aa11.65□□□□□ -0.54
PSMB4-204ENST00000476467 OR6V1Q8N148 313 aa11.65□□□□□ -0.54
PSMB4-204ENST00000476467 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PSMB4-204ENST00000476467 PRR7Q8TB68 274 aa11.65□□□□□ -0.54
PSMB4-204ENST00000476467 HPS1Q92902 700 aa11.65□□□□□ -0.54
PSMB4-204ENST00000476467 TSSK2Q96PF2 358 aa11.65□□□□□ -0.54
PSMB4-204ENST00000476467 TBX5Q99593 518 aa11.65□□□□□ -0.54
PSMB4-204ENST00000476467 OR51V1Q9H2C8 321 aa11.65□□□□□ -0.54
PSMB4-204ENST00000476467 PIGMQ9H3S5 423 aa11.65□□□□□ -0.54
PSMB4-204ENST00000476467 UPB1Q9UBR1 384 aa11.65□□□□□ -0.54
PSMB4-204ENST00000476467 PRSS50Q9UI38 385 aa11.65□□□□□ -0.54
PSMB4-204ENST00000476467 CHD6Q8TD26 2715 aa11.65□□□□□ -0.54
PSMB4-204ENST00000476467 FREM1Q5H8C1 2179 aa11.65□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa11.64□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 DAPL1A0PJW8 107 aa11.64□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 ZNF587BE7ETH6 402 aa11.64□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 DCTN6O00399 190 aa11.64□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 DHHO43323 396 aa11.64□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 CLUP10909 449 aa11.64□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 IL7P13232 177 aa11.64□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 INSL4Q14641 139 aa11.64□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 SLC35D3Q5M8T2 416 aa11.64□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 FBXW9Q5XUX1 488 aa11.64□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 XKRXQ6PP77 449 aa11.64□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 FAM131AQ6UXB0 335 aa11.64□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 LINGO2Q7L985 606 aa11.64□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 UBE2J2Q8N2K1 259 aa11.64□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 OR10H4Q8NGA5 316 aa11.64□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 GPR35Q9HC97 309 aa11.64□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 B9D1Q9UPM9 204 aa11.64□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 MOKQ9UQ07 419 aa11.64□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa11.64□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 DVL2O14641 736 aa11.64□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 GYPBP06028 91 aa11.64□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 SBK2P0C263 348 aa11.64□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 PYCR1P32322 319 aa11.64□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 RPS7P62081 194 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 CBX3Q13185 183 aa11.64□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 CHAC2Q8WUX2 184 aa11.64□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 NSMAFQ92636 917 aa11.64□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 DIRAS2Q96HU8 199 aa11.64□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 ADGRL4Q9HBW9 690 aa11.64□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 CRLF2Q9HC73 371 aa11.64□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 HAO2Q9NYQ3 351 aa11.64□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 FABP12A6NFH5 140 aa11.63□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 MSTNO14793 375 aa11.63□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 GLCEO94923 617 aa11.63□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 BMP5P22003 454 aa11.63□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 ZNF84P51523 738 aa11.63□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 PPP3R1P63098 170 aa11.63□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 ADORA2A-AS1P86434 159 aa11.63□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 FAPQ12884 760 aa11.63□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 ETFDHQ16134 617 aa11.63□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 CEACAM16Q2WEN9 425 aa11.63□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 LCN1P1Q5VSP4 162 aa11.63□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 MYO7BQ6PIF6 2116 aa11.63□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 Q6ZT83 130 aa11.63□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 SPATC1Q76KD6 591 aa11.63□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa11.63□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 GDPD1Q8N9F7 314 aa11.63□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 CCDC120Q96HB5 630 aa11.63□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 ATF6BQ99941 703 aa11.63□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 A0A1W2PQ09 198 aa11.63□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 MT-ND5P03915 603 aa11.63□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 MPGP29372 298 aa11.63□□□□□ -0.55
PSMB4-204ENST00000476467 RFX2P48378 723 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.5 ms