RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000004097.15

Cux1-201, Transcript of Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cux1, Length 12,862 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1-201ENSMUST00000004097 PirQ9D711 290 aa7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 PahP16331 453 aa7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 TpoP35419 914 aa7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Ybx1P62960 322 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Zfpm2Q8CCH7 1151 aa7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 MepeQ8K4L6 441 aa7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr1377Q8VGH1 307 aa7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Retreg3Q9CQV4 466 aa7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Efhc1Q9D9T8 648 aa7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr971Q9EQ96 307 aa7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Rab9aQ9R0M6 201 aa7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Tmem156A0A1D5RLR8 321 aa7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Rbm24D3Z4I3 236 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Mettl7a3G3X9G9 244 aa7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr893K7N678 312 aa7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Slc37a3Q3TIT8 494 aa7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Arv1Q9D0U9 266 aa7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Samd8Q9DA37 478 aa7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 PrkraQ9WTX2 313 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr485A0A140LJF5 317 aa7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 A0A286YCH8 300 aa7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 3110040M04RikA0A286YDK0 300 aa7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 A0A286YE43 300 aa7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gm6665F6Y363 85 aa7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Msl3l2G3X992 371 aa7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Dpy19l2P0CW70 773 aa7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Ctla2aP12399 137 aa7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 P18529 117 aa7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Rab5bP61021 215 aa7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 CebpdQ00322 268 aa7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Pnrc1Q3TWH3 297 aa7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gm10644Q3TZG3 87 aa7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Sqstm1Q64337 442 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gpr153Q8K0Z9 631 aa7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Rgs13Q8K443 158 aa7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Tor2aQ8R1J9 321 aa7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gm11214V9GX06 183 aa7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 EmdO08579 259 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 PtgdsO09114 189 aa7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Adrb2P18762 418 aa7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Meox2P32443 303 aa7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Il10rbQ61190 349 aa7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Zdhhc24Q6IR37 284 aa7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Znf385bQ8BXJ8 482 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Slc35a4Q9D321 324 aa7.58□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Flt3lgP49772 232 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 ActbP60710 375 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Mdga1Q0PMG2 940 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Tle4Q62441 773 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Cpeb4Q7TN98 729 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Creg2Q8BGC9 288 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Mettl2Q8BMK1 389 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 PigtQ8BXQ2 582 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Ildr1Q8CBR1 537 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Fn3krpQ8K274 309 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr1420Q8VF55 309 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gbgt1Q8VI38 347 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Mtcl1Q3UHU5 1945 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 UbbP0CG49 305 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 NppcQ61839 126 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gm10277Q6R5C6 214 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Ffar4Q7TMA4 361 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Noxo1Q8VCM2 349 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr827Q8VEV5 322 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Tmem135Q9CYV5 458 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 DpysQ9EQF5 519 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 H60cB1B213 197 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 SftpcP21841 193 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Alox5apP30355 161 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Pbx1P41778 430 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 FrzbP97401 323 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Fut4Q11127 433 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gpat2Q14DK4 801 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Sntb2Q61235 520 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Smim4Q8C1Q6 80 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr791Q8VGJ0 312 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr1242Q8VGM6 306 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Rpl7l1Q9D8M4 246 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Prl8a1Q9DAV8 240 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr1406E9Q8X1 310 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Cd200O54901 278 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Pim1P06803 397 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 GusbP12265 648 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Prkar2aP12367 401 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 PpiaP17742 164 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Acsf3Q3URE1 583 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr1101Q7TR59 310 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Chrnb4Q8R493 495 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr1342Q8VFY3 315 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Prb1Q91X93 504 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 HaghQ99KB8 309 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Pramef25A2ASI9 494 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gm14597A2CFG5 200 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Agr2O88312 175 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Cldn1O88551 211 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Elmod2Q8BGF6 293 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Tmem108Q8BHE4 574 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Lrfn3Q8BLY3 626 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Tmem30aQ8VEK0 364 aa7.57□□□□□ -1.2
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr1462Q8VFW3 307 aa7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 47.4 ms