Protein–RNA interactions for Protein: Q00322

Cebpd, CCAAT/enhancer-binding protein delta, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpdQ00322 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30,77■■■□□ 2,52
CebpdQ00322 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
CebpdQ00322 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
CebpdQ00322 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
CebpdQ00322 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27,05■■□□□ 1,92
CebpdQ00322 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
CebpdQ00322 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,61■■□□□ 1,85
CebpdQ00322 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26,56■■□□□ 1,84
CebpdQ00322 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26,48■■□□□ 1,83
CebpdQ00322 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
CebpdQ00322 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
CebpdQ00322 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
CebpdQ00322 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
CebpdQ00322 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25,7■■□□□ 1,7
CebpdQ00322 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
CebpdQ00322 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,51■■□□□ 1,68
CebpdQ00322 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25,47■■□□□ 1,67
CebpdQ00322 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
CebpdQ00322 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
CebpdQ00322 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
CebpdQ00322 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
CebpdQ00322 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
CebpdQ00322 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
CebpdQ00322 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
CebpdQ00322 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24,93■■□□□ 1,58
CebpdQ00322 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
CebpdQ00322 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
CebpdQ00322 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24,88■■□□□ 1,57
CebpdQ00322 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,86■■□□□ 1,57
CebpdQ00322 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
CebpdQ00322 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
CebpdQ00322 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24,64■■□□□ 1,54
CebpdQ00322 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,51■■□□□ 1,51
CebpdQ00322 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
CebpdQ00322 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
CebpdQ00322 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,42■■□□□ 1,5
CebpdQ00322 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
CebpdQ00322 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
CebpdQ00322 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
CebpdQ00322 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24,23■■□□□ 1,47
CebpdQ00322 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24,16■■□□□ 1,46
CebpdQ00322 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,46
CebpdQ00322 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
CebpdQ00322 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
CebpdQ00322 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
CebpdQ00322 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,02■■□□□ 1,44
CebpdQ00322 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
CebpdQ00322 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
CebpdQ00322 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,92■■□□□ 1,42
CebpdQ00322 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
CebpdQ00322 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
CebpdQ00322 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
CebpdQ00322 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
CebpdQ00322 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23,74■■□□□ 1,39
CebpdQ00322 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23,73■■□□□ 1,39
CebpdQ00322 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
CebpdQ00322 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23,7■■□□□ 1,38
CebpdQ00322 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
CebpdQ00322 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,6■■□□□ 1,37
CebpdQ00322 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23,57■■□□□ 1,36
CebpdQ00322 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
CebpdQ00322 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
CebpdQ00322 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
CebpdQ00322 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,46■■□□□ 1,35
CebpdQ00322 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23,44■■□□□ 1,34
CebpdQ00322 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23,44■■□□□ 1,34
CebpdQ00322 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
CebpdQ00322 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
CebpdQ00322 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
CebpdQ00322 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23,38■■□□□ 1,33
CebpdQ00322 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
CebpdQ00322 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,32
CebpdQ00322 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
CebpdQ00322 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,31■■□□□ 1,32
CebpdQ00322 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,31■■□□□ 1,32
CebpdQ00322 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
CebpdQ00322 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,23■■□□□ 1,31
CebpdQ00322 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
CebpdQ00322 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23,18■■□□□ 1,3
CebpdQ00322 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
CebpdQ00322 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23,14■■□□□ 1,29
CebpdQ00322 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
CebpdQ00322 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23,11■■□□□ 1,29
CebpdQ00322 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23,1■■□□□ 1,29
CebpdQ00322 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23,09■■□□□ 1,29
CebpdQ00322 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
CebpdQ00322 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
CebpdQ00322 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
CebpdQ00322 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22,94■■□□□ 1,26
CebpdQ00322 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
CebpdQ00322 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22,9■■□□□ 1,26
CebpdQ00322 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
CebpdQ00322 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22,86■■□□□ 1,25
CebpdQ00322 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
CebpdQ00322 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
CebpdQ00322 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
CebpdQ00322 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
CebpdQ00322 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22,77■■□□□ 1,24
CebpdQ00322 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
CebpdQ00322 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22,3 ms