Protein–RNA interactions for Protein: Q00322

Cebpd, CCAAT/enhancer-binding protein delta, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpdQ00322 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
CebpdQ00322 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CebpdQ00322 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CebpdQ00322 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CebpdQ00322 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CebpdQ00322 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CebpdQ00322 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CebpdQ00322 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CebpdQ00322 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CebpdQ00322 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CebpdQ00322 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CebpdQ00322 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CebpdQ00322 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CebpdQ00322 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CebpdQ00322 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CebpdQ00322 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
CebpdQ00322 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CebpdQ00322 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CebpdQ00322 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CebpdQ00322 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CebpdQ00322 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CebpdQ00322 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CebpdQ00322 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CebpdQ00322 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CebpdQ00322 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CebpdQ00322 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CebpdQ00322 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CebpdQ00322 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CebpdQ00322 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CebpdQ00322 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CebpdQ00322 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CebpdQ00322 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CebpdQ00322 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CebpdQ00322 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CebpdQ00322 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CebpdQ00322 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CebpdQ00322 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CebpdQ00322 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CebpdQ00322 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CebpdQ00322 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CebpdQ00322 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CebpdQ00322 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CebpdQ00322 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CebpdQ00322 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CebpdQ00322 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CebpdQ00322 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CebpdQ00322 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CebpdQ00322 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CebpdQ00322 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CebpdQ00322 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CebpdQ00322 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CebpdQ00322 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CebpdQ00322 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CebpdQ00322 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CebpdQ00322 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CebpdQ00322 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CebpdQ00322 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CebpdQ00322 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CebpdQ00322 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CebpdQ00322 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CebpdQ00322 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CebpdQ00322 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CebpdQ00322 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CebpdQ00322 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CebpdQ00322 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CebpdQ00322 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CebpdQ00322 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CebpdQ00322 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CebpdQ00322 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CebpdQ00322 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CebpdQ00322 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CebpdQ00322 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CebpdQ00322 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CebpdQ00322 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CebpdQ00322 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CebpdQ00322 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CebpdQ00322 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CebpdQ00322 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CebpdQ00322 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CebpdQ00322 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CebpdQ00322 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CebpdQ00322 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CebpdQ00322 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CebpdQ00322 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CebpdQ00322 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CebpdQ00322 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CebpdQ00322 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CebpdQ00322 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CebpdQ00322 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CebpdQ00322 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CebpdQ00322 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CebpdQ00322 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CebpdQ00322 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CebpdQ00322 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CebpdQ00322 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CebpdQ00322 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CebpdQ00322 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CebpdQ00322 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CebpdQ00322 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CebpdQ00322 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms