Protein–RNA interactions for Protein: Q8K274

Fn3krp, Ketosamine-3-kinase, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fn3krpQ8K274 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Fn3krpQ8K274 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fn3krpQ8K274 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fn3krpQ8K274 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fn3krpQ8K274 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fn3krpQ8K274 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fn3krpQ8K274 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fn3krpQ8K274 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Fn3krpQ8K274 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fn3krpQ8K274 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Fn3krpQ8K274 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Fn3krpQ8K274 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fn3krpQ8K274 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Fn3krpQ8K274 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fn3krpQ8K274 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fn3krpQ8K274 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Fn3krpQ8K274 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fn3krpQ8K274 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fn3krpQ8K274 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fn3krpQ8K274 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fn3krpQ8K274 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fn3krpQ8K274 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fn3krpQ8K274 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fn3krpQ8K274 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Fn3krpQ8K274 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fn3krpQ8K274 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fn3krpQ8K274 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fn3krpQ8K274 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fn3krpQ8K274 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fn3krpQ8K274 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fn3krpQ8K274 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fn3krpQ8K274 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fn3krpQ8K274 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fn3krpQ8K274 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fn3krpQ8K274 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fn3krpQ8K274 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Fn3krpQ8K274 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fn3krpQ8K274 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fn3krpQ8K274 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fn3krpQ8K274 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fn3krpQ8K274 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Fn3krpQ8K274 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fn3krpQ8K274 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fn3krpQ8K274 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fn3krpQ8K274 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fn3krpQ8K274 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fn3krpQ8K274 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fn3krpQ8K274 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Fn3krpQ8K274 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fn3krpQ8K274 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fn3krpQ8K274 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fn3krpQ8K274 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fn3krpQ8K274 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fn3krpQ8K274 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fn3krpQ8K274 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fn3krpQ8K274 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fn3krpQ8K274 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Fn3krpQ8K274 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fn3krpQ8K274 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fn3krpQ8K274 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fn3krpQ8K274 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fn3krpQ8K274 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fn3krpQ8K274 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fn3krpQ8K274 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fn3krpQ8K274 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fn3krpQ8K274 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fn3krpQ8K274 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fn3krpQ8K274 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fn3krpQ8K274 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fn3krpQ8K274 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fn3krpQ8K274 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fn3krpQ8K274 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Fn3krpQ8K274 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fn3krpQ8K274 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fn3krpQ8K274 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fn3krpQ8K274 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fn3krpQ8K274 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fn3krpQ8K274 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Fn3krpQ8K274 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fn3krpQ8K274 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fn3krpQ8K274 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fn3krpQ8K274 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fn3krpQ8K274 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fn3krpQ8K274 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Fn3krpQ8K274 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fn3krpQ8K274 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fn3krpQ8K274 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fn3krpQ8K274 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fn3krpQ8K274 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fn3krpQ8K274 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fn3krpQ8K274 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fn3krpQ8K274 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fn3krpQ8K274 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fn3krpQ8K274 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fn3krpQ8K274 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fn3krpQ8K274 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fn3krpQ8K274 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fn3krpQ8K274 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fn3krpQ8K274 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fn3krpQ8K274 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms