Protein–RNA interactions for Protein: Q61235

Sntb2, Beta-2-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntb2Q61235 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Sntb2Q61235 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Sntb2Q61235 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sntb2Q61235 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sntb2Q61235 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sntb2Q61235 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sntb2Q61235 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Sntb2Q61235 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sntb2Q61235 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sntb2Q61235 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sntb2Q61235 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sntb2Q61235 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Sntb2Q61235 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sntb2Q61235 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sntb2Q61235 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sntb2Q61235 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sntb2Q61235 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sntb2Q61235 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sntb2Q61235 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sntb2Q61235 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Sntb2Q61235 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Sntb2Q61235 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sntb2Q61235 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sntb2Q61235 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sntb2Q61235 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Sntb2Q61235 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sntb2Q61235 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Sntb2Q61235 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sntb2Q61235 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sntb2Q61235 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sntb2Q61235 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sntb2Q61235 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sntb2Q61235 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Sntb2Q61235 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sntb2Q61235 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sntb2Q61235 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sntb2Q61235 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Sntb2Q61235 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sntb2Q61235 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sntb2Q61235 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sntb2Q61235 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sntb2Q61235 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sntb2Q61235 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Sntb2Q61235 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sntb2Q61235 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sntb2Q61235 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sntb2Q61235 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sntb2Q61235 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Sntb2Q61235 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sntb2Q61235 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sntb2Q61235 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sntb2Q61235 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sntb2Q61235 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sntb2Q61235 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sntb2Q61235 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sntb2Q61235 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sntb2Q61235 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sntb2Q61235 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sntb2Q61235 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sntb2Q61235 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sntb2Q61235 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sntb2Q61235 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Sntb2Q61235 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sntb2Q61235 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sntb2Q61235 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sntb2Q61235 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sntb2Q61235 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sntb2Q61235 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sntb2Q61235 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sntb2Q61235 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sntb2Q61235 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sntb2Q61235 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sntb2Q61235 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sntb2Q61235 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sntb2Q61235 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sntb2Q61235 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sntb2Q61235 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sntb2Q61235 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sntb2Q61235 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sntb2Q61235 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sntb2Q61235 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sntb2Q61235 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sntb2Q61235 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sntb2Q61235 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sntb2Q61235 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sntb2Q61235 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sntb2Q61235 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sntb2Q61235 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sntb2Q61235 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sntb2Q61235 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sntb2Q61235 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sntb2Q61235 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sntb2Q61235 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Sntb2Q61235 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sntb2Q61235 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sntb2Q61235 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sntb2Q61235 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sntb2Q61235 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sntb2Q61235 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sntb2Q61235 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms