Protein–RNA interactions for Protein: Q8R493

Chrnb4, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb4Q8R493 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Chrnb4Q8R493 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Chrnb4Q8R493 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Chrnb4Q8R493 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chrnb4Q8R493 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Chrnb4Q8R493 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Chrnb4Q8R493 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Chrnb4Q8R493 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Chrnb4Q8R493 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Chrnb4Q8R493 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Chrnb4Q8R493 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Chrnb4Q8R493 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chrnb4Q8R493 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Chrnb4Q8R493 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chrnb4Q8R493 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chrnb4Q8R493 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chrnb4Q8R493 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Chrnb4Q8R493 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chrnb4Q8R493 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chrnb4Q8R493 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chrnb4Q8R493 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chrnb4Q8R493 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chrnb4Q8R493 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chrnb4Q8R493 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chrnb4Q8R493 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chrnb4Q8R493 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chrnb4Q8R493 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Chrnb4Q8R493 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chrnb4Q8R493 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chrnb4Q8R493 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chrnb4Q8R493 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chrnb4Q8R493 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chrnb4Q8R493 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Chrnb4Q8R493 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chrnb4Q8R493 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chrnb4Q8R493 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Chrnb4Q8R493 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chrnb4Q8R493 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Chrnb4Q8R493 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Chrnb4Q8R493 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chrnb4Q8R493 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chrnb4Q8R493 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chrnb4Q8R493 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chrnb4Q8R493 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chrnb4Q8R493 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Chrnb4Q8R493 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Chrnb4Q8R493 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Chrnb4Q8R493 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Chrnb4Q8R493 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chrnb4Q8R493 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chrnb4Q8R493 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chrnb4Q8R493 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chrnb4Q8R493 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chrnb4Q8R493 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chrnb4Q8R493 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Chrnb4Q8R493 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chrnb4Q8R493 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chrnb4Q8R493 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chrnb4Q8R493 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chrnb4Q8R493 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chrnb4Q8R493 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chrnb4Q8R493 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chrnb4Q8R493 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Chrnb4Q8R493 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chrnb4Q8R493 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Chrnb4Q8R493 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chrnb4Q8R493 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chrnb4Q8R493 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chrnb4Q8R493 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chrnb4Q8R493 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Chrnb4Q8R493 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chrnb4Q8R493 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chrnb4Q8R493 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chrnb4Q8R493 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chrnb4Q8R493 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chrnb4Q8R493 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chrnb4Q8R493 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chrnb4Q8R493 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chrnb4Q8R493 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chrnb4Q8R493 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chrnb4Q8R493 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chrnb4Q8R493 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chrnb4Q8R493 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chrnb4Q8R493 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chrnb4Q8R493 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chrnb4Q8R493 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chrnb4Q8R493 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chrnb4Q8R493 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chrnb4Q8R493 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chrnb4Q8R493 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chrnb4Q8R493 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chrnb4Q8R493 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chrnb4Q8R493 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chrnb4Q8R493 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chrnb4Q8R493 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Chrnb4Q8R493 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chrnb4Q8R493 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chrnb4Q8R493 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chrnb4Q8R493 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chrnb4Q8R493 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms