Protein–RNA interactions for Protein: P12399

Ctla2a, Protein CTLA-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla2aP12399 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Ctla2aP12399 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,14■■■□□ 2,42
Ctla2aP12399 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Ctla2aP12399 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Ctla2aP12399 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,51■■■□□ 2,31
Ctla2aP12399 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29,27■■■□□ 2,28
Ctla2aP12399 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Ctla2aP12399 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Ctla2aP12399 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Ctla2aP12399 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Ctla2aP12399 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Ctla2aP12399 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Ctla2aP12399 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Ctla2aP12399 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Ctla2aP12399 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Ctla2aP12399 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Ctla2aP12399 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,58■■■□□ 2,01
Ctla2aP12399 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Ctla2aP12399 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27,16■■□□□ 1,94
Ctla2aP12399 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Ctla2aP12399 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Ctla2aP12399 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Ctla2aP12399 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Ctla2aP12399 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Ctla2aP12399 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Ctla2aP12399 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,75■■□□□ 1,87
Ctla2aP12399 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Ctla2aP12399 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Ctla2aP12399 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,69■■□□□ 1,86
Ctla2aP12399 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Ctla2aP12399 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,67■■□□□ 1,86
Ctla2aP12399 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,84
Ctla2aP12399 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Ctla2aP12399 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Ctla2aP12399 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26,37■■□□□ 1,81
Ctla2aP12399 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Ctla2aP12399 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,32■■□□□ 1,8
Ctla2aP12399 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Ctla2aP12399 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Ctla2aP12399 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Ctla2aP12399 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26,23■■□□□ 1,79
Ctla2aP12399 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,79
Ctla2aP12399 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26,19■■□□□ 1,78
Ctla2aP12399 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,18■■□□□ 1,78
Ctla2aP12399 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Ctla2aP12399 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Ctla2aP12399 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Ctla2aP12399 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Ctla2aP12399 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26■■□□□ 1,75
Ctla2aP12399 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Ctla2aP12399 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Ctla2aP12399 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Ctla2aP12399 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Ctla2aP12399 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Ctla2aP12399 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Ctla2aP12399 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,65■■□□□ 1,7
Ctla2aP12399 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,65■■□□□ 1,7
Ctla2aP12399 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Ctla2aP12399 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Ctla2aP12399 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Ctla2aP12399 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Ctla2aP12399 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Ctla2aP12399 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Ctla2aP12399 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Ctla2aP12399 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Ctla2aP12399 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Ctla2aP12399 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,33■■□□□ 1,65
Ctla2aP12399 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Ctla2aP12399 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,33■■□□□ 1,65
Ctla2aP12399 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Ctla2aP12399 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Ctla2aP12399 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Ctla2aP12399 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Ctla2aP12399 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25,25■■□□□ 1,63
Ctla2aP12399 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
Ctla2aP12399 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Ctla2aP12399 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25,09■■□□□ 1,61
Ctla2aP12399 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Ctla2aP12399 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Ctla2aP12399 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Ctla2aP12399 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Ctla2aP12399 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Ctla2aP12399 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25,01■■□□□ 1,59
Ctla2aP12399 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1,59
Ctla2aP12399 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Ctla2aP12399 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Ctla2aP12399 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Ctla2aP12399 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Ctla2aP12399 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,93■■□□□ 1,58
Ctla2aP12399 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Ctla2aP12399 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Ctla2aP12399 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Ctla2aP12399 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Ctla2aP12399 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Ctla2aP12399 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24,75■■□□□ 1,55
Ctla2aP12399 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Ctla2aP12399 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Ctla2aP12399 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Ctla2aP12399 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24,62■■□□□ 1,53
Ctla2aP12399 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24,59■■□□□ 1,53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms