Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
UbbP0CG49 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
UbbP0CG49 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UbbP0CG49 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
UbbP0CG49 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UbbP0CG49 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
UbbP0CG49 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UbbP0CG49 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UbbP0CG49 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UbbP0CG49 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UbbP0CG49 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UbbP0CG49 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
UbbP0CG49 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UbbP0CG49 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
UbbP0CG49 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
UbbP0CG49 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UbbP0CG49 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UbbP0CG49 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
UbbP0CG49 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UbbP0CG49 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UbbP0CG49 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
UbbP0CG49 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UbbP0CG49 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UbbP0CG49 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UbbP0CG49 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UbbP0CG49 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
UbbP0CG49 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UbbP0CG49 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UbbP0CG49 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UbbP0CG49 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UbbP0CG49 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UbbP0CG49 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UbbP0CG49 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UbbP0CG49 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UbbP0CG49 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
UbbP0CG49 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UbbP0CG49 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UbbP0CG49 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UbbP0CG49 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
UbbP0CG49 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UbbP0CG49 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UbbP0CG49 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UbbP0CG49 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UbbP0CG49 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UbbP0CG49 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UbbP0CG49 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
UbbP0CG49 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UbbP0CG49 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UbbP0CG49 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UbbP0CG49 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UbbP0CG49 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
UbbP0CG49 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UbbP0CG49 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UbbP0CG49 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UbbP0CG49 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UbbP0CG49 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UbbP0CG49 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UbbP0CG49 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
UbbP0CG49 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
UbbP0CG49 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UbbP0CG49 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
UbbP0CG49 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UbbP0CG49 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UbbP0CG49 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UbbP0CG49 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UbbP0CG49 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UbbP0CG49 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UbbP0CG49 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UbbP0CG49 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UbbP0CG49 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UbbP0CG49 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UbbP0CG49 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UbbP0CG49 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UbbP0CG49 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UbbP0CG49 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UbbP0CG49 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UbbP0CG49 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UbbP0CG49 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UbbP0CG49 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UbbP0CG49 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UbbP0CG49 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UbbP0CG49 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UbbP0CG49 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UbbP0CG49 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UbbP0CG49 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UbbP0CG49 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UbbP0CG49 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UbbP0CG49 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UbbP0CG49 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UbbP0CG49 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UbbP0CG49 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UbbP0CG49 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UbbP0CG49 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UbbP0CG49 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
UbbP0CG49 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UbbP0CG49 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UbbP0CG49 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UbbP0CG49 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UbbP0CG49 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UbbP0CG49 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms